1564286-24-3
中文名称
Cy5 DBCO
英文名称
Cy5 DBCO
CAS
1564286-24-3
分子式
C52H56N4O11S3
分子量
1009.22
MOL 文件
1564286-24-3.mol
更新日期
2025/09/03 14:17:01
1564286-24-3 结构式
基本信息
中文别名
叠氮化物反应探针水溶-DBCO CY5
磺基氰CY5二苯基环辛炔
磺基菁染料CY5-二苯并环辛炔
英文别名
Cy5 DBCODBCO-Sulfo-Cy5
Sulfo-Cy5 DBCO
Cy5-DBCO (Synonyms: DBCO-Sulfo-Cy5)
所属类别
生物化工：荧光成像物理化学性质
外观性状外观 : 深蓝色固体
ex/em : 649/672 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 271000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.28
ex/em : 649/672 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 271000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.28
溶解度Soluble in Water, DMSO, DMF, DCM
形态Solid
颜色Blue to black
外观Dark blue solid
ε(消光系数)271000 L⋅mol−1⋅cm−1
Φ(量子产率)0.28
激发峰(Ex)/发射峰(Em)649/672 nm (PBS buffer)
InChIKeyLQHUKJFMCCLWEL-UHFFFAOYSA-N
SMILESC([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=C12)C=CC=CC=C1C(C2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=C2N1CCCCCC(=O)NCCC(N1CC2=CC=CC=C2C#CC2=CC=CC=C12)=O)(C)C)CCS([O-])(=O)=O
常见问题列表
荧光标记染料
磺化Cy5是Cy5(Cyanine 5)的水溶型。它的光谱性质和Cy5类似，在荧光显微镜下发远红色荧光。它荧光亮，对pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激发然后用 Cy5或APC滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。磺化Cy5荧光落在远红光区，使用磺化Cy5或者其它远红光染料的一个重要优势是在这个长波长光谱范围内样品背景荧光较低，而在这个区域CCD相机/检测器检测灵敏度最高。磺化Cy5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子等。磺化Cy5水溶性非常好，可在水相标记反应体系中直接使用，不需要有机溶剂助溶，特别适合标记对有机溶剂敏感的生物分子。另外由于强水溶性加染料分子本身带电荷，磺化Cy5标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。
DBCO(dibenzocyclooctyne，DIBAC)是常用点击化学生物标记基团。在无铜点击化学(copper-free click chemistry)中，DBCO是最常用的张环辛炔，它反应快(二级速率常数：0.3 to 0.9 M-1s-1)，效率高，适合对蛋白，细胞，动物体内生物标记。无铜点击化学标记简单易行，反应选择性高，无铜离子干扰(铜离子螯合沉淀蛋白，细胞毒性等)，试剂消耗小，特别适合复杂体系的荧光标记。
磺化Cy5标记后的产物Ex/Em是649/672nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。
注意事项
- 磺化Cy5水溶性高，极性强，本产品可以水相直接反应标记。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
生物活性
Cy5-DBCO (DBCO-Sulfo-Cy5) 是一个近红外 (NIR) 红色荧光染料 λabs 和 λem 值分别为 646 nm 和 670 nm。Cy5-DBCO (DBCO-Sulfo-Cy5) 不适合对通透性细胞的胞内成分进行染色，可能会表现出较高的背景。靶点
Red fluorescent dye
体外研究
Cy5-DBCO (DBCO-Sulfo-Cy5) reacts with azides via a copper-free “click chemistry” reaction and forms a stable triazole and does not need Cu-catalyst or elevated temperatures.