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2183440-43-7

中文名称 水溶性Cy3-NH2
英文名称 diSulfo-Cy3 amine
CAS 2183440-43-7
分子式 C36H50N4O7S2
分子量 714.94
MOL 文件 2183440-43-7.mol
更新日期 2025/08/15 17:18:03
2183440-43-7 结构式 2183440-43-7 结构式

基本信息

中文别名
磺化CY3-伯胺
二磺酸-CY3-氨基
水溶性CY3-NH2
水溶性CY3 NH2/氨基
英文别名
Sulfo CY3-NH2
diSulfo-Cy3 amine
所属类别
生物:染料/染色剂

物理化学性质

外观性状外观 :    红色固体
ex/em :    550/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) :    150000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) :    0.10
溶解度Soluble in water, alcohols, DMSO, DMF
形态Solid
颜色Brown to dark brown
外观Red solid
ε(消光系数)150000 L⋅mol−1⋅cm−1
Φ(量子产率)0.10
激发峰(Ex)/发射峰(Em)550/566 nm (PBS buffer)
InChIKeyZVOZJQQPUBRDRD-UHFFFAOYSA-N
SMILESC([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C12)C=CC=C1N(C2=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C2C1(C)C)C)CCCCC(=O)NCCCCCCN

常见问题列表

概述
水溶性Cy3-NH2 是带有胺基团的 Cyanine 3 (Cy3) (HY-D0822) 染料衍生物。磺酸根离子增加了化合物的水溶性,使其适用于水性溶液。Cy3 是一种荧光染料,荧光光谱通常在绿色至橙色的波长范围内。Sulfo-Cy3 amine 的胺官能团可以与羧基反应,形成共价键。Sulfo-Cy3 amine 能够与蛋白质、抗体等生物分子结合,追踪它们在生物样品中的位置和动态变化。
荧光标记染料
磺化Cy3是Cy3(Cyanine 3)的水溶型。它的光谱性质和Cy3类似,在荧光显微镜下发橘黄色荧光。它的荧光很亮,并且对pH不敏感,一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察,所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后,样品背景荧光一般认为比TAMRA等系列的染料低。 磺化Cy3可以用来标记蛋白,抗体,多肽,核酸等各种生物分子。
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基,伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯,N-hydroxysuccinimide ester,succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S,isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接,从而把Cy3分子连接到目标分子上。
磺化Cy3-伯胺的水溶性极高,所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂,特别适合标记对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy3水溶性极好,并且染料分子本身带电荷,标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集,提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy3-伯胺也溶于甲醇,DMSO,DMF等有机溶剂,标记反应也可以在纯有机溶剂中进行
磺化Cy3-伯胺标记后的产物Ex/Em是550/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA,Alexa Fluor 555,DyLight 550,BODIPY® TMR-X等。
注意事项
  • 磺化Cy3水溶性高,极性强,如需脂溶性标记染料,请选择普通Cy3-伯胺。
  • 标记时使用不含氨基的缓冲体系,比如磷酸钠缓冲液(PBS),Hepes缓冲液,碳酸氢钠缓冲液;或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液,比如Tris,甘氨酸等,它们会和磺化Cy3上的伯胺竞争。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
  • 标记反应不要放在强光下,因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
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