407627-61-6

中文名称 AF 647 NHS ESTER,TEA SALT

英文名称 3H-Indolium, 2-[5-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-3-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3)

CAS 407627-61-6

分子式 C46H64N4O16S4

分子量 1057.27

MOL 文件 407627-61-6.mol

407627-61-6 结构式

基本信息物理化学性质常见问题列表

基本信息

中文别名

OKF647(C6) 琥珀酰胺亚胺酯.三乙胺盐
AF 647 NHS ESTER,TEA SALT

英文别名

AF647-NHS ester triTEA
3H-Indolium, 2-[5-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-3-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3)

物理化学性质

外观性状外观 : 深蓝色固体
ex/em : 651/672 nm
消光系数(ε) : 261,000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.33

溶解度易溶于水, DMSO, DMF等

形态Solid

颜色Blue to dark blue

外观Dark blue solid

ε(消光系数)261,000 L⋅mol−1⋅cm−1

Φ(量子产率)0.33

激发峰(Ex)/发射峰(Em)651/672 nm

常见问题列表

概述

AF647-NHS ester 是 Alexa Fluor 647 (AF647) 的类似物，AF647 的激发波长 (λex) 为 635 nm (常规荧光检测)/620 nm (瞬时检测)。

荧光标记染料

AF647（Alexa Fluor 647）是Alexa Fluor染料家族中一种发远红（far-red）荧光的染料，是最常用的一种AF染料之一，在重要实验中，常常被用于替代Cy5染料。AF647的极性大，水溶性极好，荧光稳定性能也不错，能耐受较长时间照射，特别适应于标记蛋白质，是二抗标记的常规荧光染料。尽管AF647的量子产率不算高，但是其消光系数非常高（即表现为颜色深，分子吸收光子能力强），所以AF647的荧光亮度很高，另外，由于远红光区样品背景弱，而CCD相机对该区光子检测都较灵敏，所以各种因素加成之下，让AF647成为最灵敏的荧光染料之一，常常可检测出丰度非常低的样品。AF647的ex/em和Cy5非常接近，因此在常规荧光显微镜时可使用Cy5滤片组；在共聚焦显微成像时，633nm激光束可以良好的激发该染料，594nm激光也可以通过该染料的肩峰激发，很好的适配了生物实验室常规平台激光器，包括常规共聚焦显微镜、流式细胞仪和荧光扫描仪等。
NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester, SE)是生物标记反应中最常用的活化基团。NHS活化AF647分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（主要伯胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把AF647荧光分子标记到生物大分子上。