477908-53-5
中文名称
CY7-N-羟基琥珀酰胺酯
英文名称
Cy3 NHS Ester
CAS
477908-53-5
分子式
C39H45N3O10S2
分子量
779.92
MOL 文件
477908-53-5.mol
更新日期
2025/08/17 17:05:30
477908-53-5 结构式
基本信息
中文别名
磺酸-CY7-琥珀酰亚胺酯CY7-N-羟基琥珀酰胺酯
英文别名
Cy7-SECy7 dye
Sulfo-Cy7-SE
Sulfo-Cy7-SE, >95%
Sulfo-Cyanine7 Succinimidyl Ester
2-[7-[1-[6-[(2,5-Dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1,3,5-heptatrien-1-yl]-1-ethyl-3,3-dimethyl-5-sulfo-3H-indolium, inner salt
所属类别
生物化工：荧光成像物理化学性质
外观性状外观 : 深绿色固体
ex/em : 748/774 nm
消光系数(ε) : 200,000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.24
ex/em : 748/774 nm
消光系数(ε) : 200,000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.24
储存条件Keep in dark place,Inert atmosphere,2-8°C
溶解度DMF: soluble; DMSO: soluble; Ethanol: soluble
形态A crystalline solid
颜色Light brown to black
外观Dark green solid
ε(消光系数)200,000 L⋅mol−1⋅cm−1
Φ(量子产率)0.24
激发峰(Ex)/发射峰(Em)748/774 nm
InChIKeyROGODJHHEBREAB-UHFFFAOYSA-N
SMILESC(N1C(C(C)(C)C2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=C12)=CC=CC=CC=CC1C(C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2[N+]=1CC)(C)C)CCCCC(=O)ON1C(CCC1=O)=O
常见问题列表
荧光标记染料
磺化Cy7是Cy7(Cyanine 7)的水溶型。它的光谱性质和Cy7类似，属近红外荧光染料。由于它的荧光波长（Em：774nm）恰好处于肌体组织近红外窗口 I 的区域（肌体的血液，体液和组织此区域背景荧光弱，而长波长穿透性强），所以磺化Cy7常常应用于小动物活体体内成像中。磺化Cy7荧光肉眼不可见，显微镜观察时需要近红外滤片，很多荧光显微镜（包括共聚焦显微镜）并不配备，但是流式细胞仪（flow cytometry）常常配备Cy7滤片组。磺化Cy7是常用荧光染料，磺化Cy7可以用来标记核酸，蛋白，抗体，多肽等，它是最常见的小动物显影剂之一。NHS活化酯 （N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物标记反应中最常用的活化基团。它活化Cy7分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把磺化Cy7分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白，抗体，多肽表面的常见官能团（来自于赖胺酸侧链），磺化Cy7-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基，只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和磺化Cy7-NHS反应。
磺化Cy7-NHS活化酯的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy7水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到蛋白表面后不会引发疏水性蛋白聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy7-NHS也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行。
磺化Cy7-NHS标记后的产物Ex/Em是748/774nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 750，DyLight 755等。
注意事项
- NHS ester基团对湿度比较敏感，务必干燥保存产品。使用前产品需放到室温回温至少20分钟。
- 使用不含氨基的缓冲体系。比如磷酸钠缓冲液（PBS），Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液；或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
生物活性
CY7-SE (Sulfo-Cyanine7 Succinimidyl Ester) 是一种荧光标记试剂 (Ex=700-770 nm，Em=790 nm)。Cyanine 染料可用于标记蛋白质，抗体，肽，寡聚核苷酸等。