CY5.5-叠氮
| 中文名称 | CY5.5-叠氮 |
|---|---|
| 中文同义词 | 2-(5-(3-(6-((3-叠氮丙基)氨基)-6-氧代己基)-1,1-二甲基-1,3-二氢-2H-苯并[E]吲哚-2-亚基)戊-1,3-二烯-1-基)-1,1,3-三甲基-1H-苯并[A]吲哚-3-鎓氯化物;花菁素CY5.5叠氮;花菁染料CY5.5-叠氮 |
| 英文名称 | 1H-Benz[e]indolium, 2-[5-[3-[6-[(3-azidopropyl)amino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-1,1-dimethyl-2H-benz[e]indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1,1,3-trimethyl-, chloride (1:1) |
| 英文同义词 | 1H-Benz[e]indolium, 2-[5-[3-[6-[(3-azidopropyl)amino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-1,1-dimethyl-2H-benz[e]indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1,1,3-trimethyl-, chloride (1:1);lipo Cy5.5(Me) N3;2-(5-(3-(6-((3-Azidopropyl)amino)-6-oxohexyl)-1,1-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-1,1,3-trimethyl-1H-benzo[e]indol-3-ium chloride?, Cyanine 5.5 azide |
| CAS号 | 1557136-25-0 |
| 分子式 | C43H49N6O.Cl |
| 分子量 | 701.34 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 化学试剂 |
| Mol文件 | 1557136-25-0.mol |
| 结构式 |  |
CY5.5-叠氮 性质
| 溶解度 | 溶于DMSO、DMF、DCM |
|---|---|
| 形态 | 固体 |
| 颜色 | 粉红至红色 |
| 外观 | Dark blue solid |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 680/698 nm (PBS buffer) |
| ε(消光系数) | 198000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.20 |
CY5.5-叠氮 是一种有效的荧光染料。Cyanine 5.5 azide 可以标记 DNA。Cyanine 5.5 azide 可用于近红外活体成像。(λex=684 nm, λem=710 nm)。Cyanine 5.5 azide 是一种点击化学试剂。它含有 Azide 基团，可以和含有 Alkyne 基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应（CuAAc)。它还可以和含有 DBCO 或 BCN 基团的分子发生环张力驱动的炔-叠氮环加成反应 (SPAAC)。Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一种发近红外（NIR）荧光的花青素荧光染料。它的消光系数高，荧光也很亮，并且对pH不敏感，并且由于它的荧光波长（Em：~700nm）恰好处于肌体组织近红外窗口 I 的区域（肌体的血液，体液和组织此区域背景荧光弱，而长波长穿透性强），所以Cy5.5常应用于小动物活体体内成像中。 Cy5.5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，纳米粒等，它最常见的使用是标记核酸分子（DNA和RNA）。
叠氮(azide)是常用生物标记基团。通过点击化学反应(click chemistry)，叠氮可以和一系列炔烃(alkyne)或环炔烃(strained alkyne)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速定量完成(几乎100%产率)，即使在低浓度(μM)和低温(4oC)下也可完成。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。
Cy5.5标记后的产物Ex/Em是680/698nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 680，DyLight 680等。
ex/em : 680/698 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 198000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.20
叠氮(azide)是常用生物标记基团。通过点击化学反应(click chemistry)，叠氮可以和一系列炔烃(alkyne)或环炔烃(strained alkyne)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速定量完成(几乎100%产率)，即使在低浓度(μM)和低温(4oC)下也可完成。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。
Cy5.5标记后的产物Ex/Em是680/698nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 680，DyLight 680等。
- Cy5.5-叠氮水溶性较低，如需在水相中标记可选择磺化Cy5.5-叠氮。
- 叠氮化合物可被强还原剂(如DTT)还原破坏，使用时务必去除还原剂。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
化学性质
外观 : 深蓝色固体ex/em : 680/698 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 198000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.20