BODi-3,橙色荧光核酸染色剂 (BODi-3, orange fluorescent nucleic acid stain)
| 中文名称 | BODi-3,橙色荧光核酸染色剂 (BODi-3, orange fluorescent nucleic acid stain) |
|---|---|
| 中文同义词 | BODi-3,橙色荧光核酸染色剂 (BODi-3, orange fluorescent nucleic acid stain) |
| 英文名称 | 2-((E)-3-[1-(3-[[3-(Dimethyl(3-[4-[(E)-3-(3-methyl-1,3-benzothiazol-3-ium-2-yl)-2-propenylidene]-1(4H)-pyridinyl]propyl)ammonio)propyl](dimethyl)ammonio]propyl)-4(1H)-pyridinylidene]-1-propenyl)-3-methyl-1,3-benzothiazol-3-ium tetraiodide |
| 英文同义词 | BOBO 3;BOBO-3 IODIDE;BENZOTHIAZOLIUM, 2,2'-[1,3-PROPANEDIYLBIS[(DIMETHYLIMINIO)-3,1-PROPANEDIYL-1(4H)-PYRIDINYL-4-YLIDENE-1-PROPENYL-3-YLIDENE]]BIS[3-METHYL-, TETRAIODIDE;Benzothiazolium, 2,2 0 -[1,3-propanediyl- bis[(dimethyliminio)-3,1-propanediyl-1(4 h )-pyridinyl- 4-ylidene-1-propen-1-yl-3-ylidene]]bis[3-methyl, tetra- iodide;Bobo 3, Bibo 3 Iodide;2-((E)-3-[1-(3-[[3-(Dimethyl(3-[4-[(E)-3-(3-methyl-1,3-benzothiazol-3-ium-2-yl)-2-propenylidene]-1(4H)-pyridinyl]propyl)ammonio)propyl](dimethyl)ammonio]propyl)-4(1H)-pyridinylidene]-1-propenyl)-3-methyl-1,3-benzothiazol-3-ium tetraiodide |
| CAS号 | 169454-17-5 |
| 分子式 | C45H58I4N6S2 |
| 分子量 | 1254.73 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | Cyanine |
| Mol文件 | 169454-17-5.mol |
| 结构式 |  |
BODi-3,橙色荧光核酸染色剂 (BODi-3, orange fluorescent nucleic acid stain) 性质
| 溶解度 | 溶于二甲基亚砜 |
|---|---|
| 形态 | 粉末 |
| 颜色 | 黄褐色 |
| 外观 | purple solution |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 570/602 nm |
| ε(消光系数) | 147800 cm−1M−1 |
| Φ(量子产率) | 0.39 |
| 最大波长(λmax) | 570 nm (H2O/DNA) |
| 主要应用 | 半导体纳米晶体 |
| 生物领域应用 | Nucleic acid hybridization; DNA fingerprinting; DNA sequencing; detecting nucleic acids,cells,pathogens; counting embryoblasts |
BoBo-3是高灵敏核酸显影剂，常用于细胞核显影。BoBo-3是BO-PRO-3的二连体(dimer)，属双菁类(Cyanine dimers)荧光探针。双菁类探针由两个单菁染料分子(一般来自托普家族，TO-PRO family)对称链接而成，共带4个正电荷。这个结构大大增强了其对DNA的亲和性，亲和能力提高可达100倍。另外，双菁类探针本身没有荧光，但是嵌入DNA后荧光增强100-1000倍，属已知最强最亮的一类核酸显影剂之一，它们的灵敏度甚至达到可以显影单个DNA链(Science 264, 822 (1994))。
双菁类探针也包含10个家族成员，它们的显影荧光也可覆盖所有可见光光谱范围，从456nm(PoPo-1)到660nm(ToTo-3)，因此从它们中总能找到一个谱段合适的探针。双菁类探针难于透过细胞膜，适用于已固定细胞的细胞核对染(counterstaining)，可用于流式细胞仪或者荧光显微镜实验。双菁类探针也用于琼脂糖胶核酸显影。
BoBo-3与核酸或细胞核结合后显红色荧光(ex/em ~ 570/602 nm)。
消光系数(ε) : 147800 cm−1M−1
量子产率(Φ) : 0.39
双菁类探针也包含10个家族成员，它们的显影荧光也可覆盖所有可见光光谱范围，从456nm(PoPo-1)到660nm(ToTo-3)，因此从它们中总能找到一个谱段合适的探针。双菁类探针难于透过细胞膜，适用于已固定细胞的细胞核对染(counterstaining)，可用于流式细胞仪或者荧光显微镜实验。双菁类探针也用于琼脂糖胶核酸显影。
BoBo-3与核酸或细胞核结合后显红色荧光(ex/em ~ 570/602 nm)。
化学性质
ex/em : 570/602 nm消光系数(ε) : 147800 cm−1M−1
量子产率(Φ) : 0.39