Cy5-炔烃
| 中文名称 | Cy5-炔烃 |
|---|---|
| 中文同义词 | CY5-炔基;花青素CY5炔基;CY5-ALKYNE脂溶;菁染料CY5炔基;花菁染料CY5炔基;花菁染料 CY5 ALKYNE;花菁素CY5炔基;花菁染料CY5标记炔烃 |
| 英文名称 | Cy5-alkyne |
| 英文同义词 | Cy5-alkyne;lipo CY5 (Me) YNE.Cl;Clickable Cy5-alkyne;3,3-Dimethyl-1-(6-oxo-6-(prop-2-yn-1-ylamino)hexyl)-2-(5-(1,3,3-trimethylindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3H-indol-1-ium chloride |
| CAS号 | 1223357-57-0 |
| 分子式 | C35H42ClN3O |
| 分子量 | 556.19 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 化学试剂;荧光染料 |
| Mol文件 | 1223357-57-0.mol |
| 结构式 |  |
Cy5-炔烃 性质
| 储存条件 | -20°C |
|---|---|
| 溶解度 | 溶于DMSO、DMF、DCM |
| 形态 | powder |
| 颜色 | Brown to black |
| 外观 | Dark blue solid |
| ε(消光系数) | 250000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.2 |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 640/664 nm (PBS buffer) |
| InChIKey | VOWXUNAERRNFLE-UHFFFAOYSA-N |
| SMILES | C([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC=CC=C12)C=CC=CC=C1C(C2=CC=CC=C2N1C)(C)C)CCCCC(=O)NCC#C.[Cl-] |
Cy5-炔烃 是一种荧光染料，用于标记叠氮蛋白，可用于分析蛋白质的翻译后修饰，糖基化等。Cyanine5 alkyne 也可以作为线粒体 OXPHOS 抑制剂，抑制癌症干细胞 (CSC) 的生长。Cyanine5 alkyne 是一种点击化学试剂。它含有 Alkyne 基团，可以和含有 Azide 基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应 (CuAAc)。Cy5 (Cyanine 5) 是一种发远红(far-red)荧光的花青素荧光染料。它的消光系数很高，荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激发然后用 Cy5或APC滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。Cy5荧光落在远红光区，使用Cy5或者其它远红光染料的一个重要优势是在这个长波长光谱范围内样品背景荧光较低，而在这个区域CCD相机/检测器检测灵敏度最高。Cy5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子，纳米粒等。
炔烃(alkyne)是常用生物标记基团。通过铜催化点击化学反应(Copper-catalyzed azide–alkyne cycloaddition, CuAAC)，炔烃可以和叠氮(azide)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速完成，即便在低浓度(μM)下。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业易得，各种生物标记应用广泛。
Cy5标记后的产物Ex/Em是640/664nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。
ex/em : 640/664 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 250000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.2
炔烃(alkyne)是常用生物标记基团。通过铜催化点击化学反应(Copper-catalyzed azide–alkyne cycloaddition, CuAAC)，炔烃可以和叠氮(azide)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速完成，即便在低浓度(μM)下。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业易得，各种生物标记应用广泛。
Cy5标记后的产物Ex/Em是640/664nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。
- Cy5-炔烃水溶性较低，如需在水相中标记可选择磺化Cy5-炔烃。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
化学性质
外观 : 深蓝色固体ex/em : 640/664 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 250000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.2