Cyanine3-氨基
| 中文名称 | Cyanine3-氨基 |
|---|---|
| 中文同义词 | CY3-氨基;CYANINE3-氨基;1-[6-[(6-氨基己基)氨基]-6-氧羰基]-2-[3-(1,3-二氢-1,3,3-三甲基-2H-吲哚-2-亚基)-1-丙烯-1-基]-3,3-二甲基-3H-吲哚氯化铵盐酸盐;花青素CY3氨基;CY3-伯胺;CY3-NH2 花菁染料CY3-氨基;菁染料CY3氨基;脂溶CY3胺 |
| 英文名称 | Cyanine3 amine |
| 英文同义词 | Cyanine3 amine;Cyanine3-amine,Cyanine3-NH2;NH2-CY3;lipo Cy3 amine;lipo Cy3(Me)NH2.HCl;Cyanine3 NH2;1-(6-((6-Aminohexyl)amino)-6-oxohexyl)-3,3-dimethyl-2-(3-(1,3,3-trimethylindolin-2-ylidene)prop-1-en-1-yl)-3H-indol-1-ium chloride hydrochloride;Cyanine3 amine hydrochloride |
| CAS号 | 2247688-56-6 |
| 分子式 | C36H52Cl2N4O |
| 分子量 | 627.74 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 化学试剂;工具分子-染料;荧光染料 |
| Mol文件 | 2247688-56-6.mol |
| 结构式 |  |
Cyanine3-氨基 性质
| 溶解度 | 溶于水、DMSO、DMF、DCM |
|---|---|
| 外观 | Red solid |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 554/566 nm (PBS buffer) |
| ε(消光系数) | 150000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.31 |
Cyanine3-氨基 是 Cyanine3 amine 的类似物，是一种有效的绿色荧光染料。Cyanine3 amine hydrochloride 具有伯胺基团，并与活性基团如 NHS 酯、羧基(在碳二亚胺活化后)和环氧化物共价偶联。(λex=555 nm，λem=570 nm)。Cy3 (Cyanine 3) 是一种发橘黄色荧光的花青素荧光染料。它的荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后，Cy3的背景荧光一般认为比TAMRA等TRITC系列的染料低。 Cy3可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子，纳米粒等。
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接，从而把Cy3分子连接到目标分子上。
Cy3-伯胺的水溶性较低，所以在水相的标记反应体系内需要使用有机共溶剂，常用有机溶剂包括DMF，DMSO和乙腈等。如需标记的分子对有机溶剂敏感，可选择磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化-Cy3-伯胺。两者的光谱性质几乎一致，因此大部分应用可相互替换。两者的主要区别在于：磺化染料是水溶性的，在水相的标记反应体系内不需要使用有机共溶剂，并且降低染料在水中聚集的可能性，增强标记效率。
Cy3-伯胺标记后的产物Ex/Em是554/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
ex/em : 554/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 150000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.31
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接，从而把Cy3分子连接到目标分子上。
Cy3-伯胺的水溶性较低，所以在水相的标记反应体系内需要使用有机共溶剂，常用有机溶剂包括DMF，DMSO和乙腈等。如需标记的分子对有机溶剂敏感，可选择磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化-Cy3-伯胺。两者的光谱性质几乎一致，因此大部分应用可相互替换。两者的主要区别在于：磺化染料是水溶性的，在水相的标记反应体系内不需要使用有机共溶剂，并且降低染料在水中聚集的可能性，增强标记效率。
Cy3-伯胺标记后的产物Ex/Em是554/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
- Cy3-伯胺水溶性较低，标记反应可在有机溶剂中进行或者含有机助溶剂的水相中进行。
- 标记时使用不含氨基的缓冲体系，比如磷酸钠缓冲液（PBS），Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液；或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等，它们会和Cy3上的伯胺竞争。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
化学性质
外观 : 红色固体ex/em : 554/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 150000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.31