PODi-3,黄色荧光核酸染料 (PODi-3, yellow fluorescent nucleic acid stain)
| 中文名称 | PODi-3,黄色荧光核酸染料 (PODi-3, yellow fluorescent nucleic acid stain) |
|---|---|
| 中文同义词 | PODi-3,黄色荧光核酸染料 (PODi-3, yellow fluorescent nucleic acid stain) |
| 英文名称 | POPO 3 |
| 英文同义词 | BENZOXAZOLIUM, 2,2'-[1,3-PROPANEDIYLBIS[(DIMETHYLIMINIO)-3,1-PROPANEDIYL-1(4H)-PYRIDINYL-4-YLIDENE-1-PROPEN-1-YL-3-YLIDENE]]BIS[3-METHYL-, TETRAIODIDE;2-((E)-3-[1-(3-[[3-(DIMETHYL(3-[4-[(E)-3-(3-METHYL-1,3-BENZOXAZOL-3-IUM-2-YL)-2-PROPENYLIDENE]-1(4H)-PYRIDINYL]PROPYL)AMMONIO)PROPYL](DIMETHYL)AMMONIO]PROPYL)-4(1H)-PYRIDINYLIDENE]-1-PROPENYL)-3-METHYL-1,3-BENZOXAZOL-3-IUM TETRAIODIDE;POPO 3;POPO 3 IODIDE |
| CAS号 | 154757-99-0 |
| 分子式 | C45H58IN6O2+3 |
| 分子量 | 841.9 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | Cyanine |
| Mol文件 | 154757-99-0.mol |
| 结构式 |  |
PODi-3,黄色荧光核酸染料 (PODi-3, yellow fluorescent nucleic acid stain) 性质
| 熔点 | >250℃ |
|---|---|
| 溶解度 | 可溶于N,N-二甲基甲酰胺 |
| 形态 | 粉末 |
| 颜色 | 黄褐色 |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 534/570 nm |
| ε(消光系数) | 146400 cm−1M−1 |
| Φ(量子产率) | 0.46 |
| 最大波长(λmax) | 534 nm |
| 生物领域应用 | Nucleic acid hybridization; detecting nucleic acids,cells,hepatitis B virus,pathogens; counting embryoblasts; biochips; nucleic acid fragment sizing |
| 主要应用 | 光子织物显示器 |
PoPo-3是高灵敏核酸显影剂，常用于细胞核显影。PoPo-3是PO-PRO-3的二连体(dimer)，属双菁类(Cyanine dimers)荧光探针。双菁类探针由两个单菁染料分子(一般来自托普家族，TO-PRO family)对称链接而成，共带4个正电荷。这个结构大大增强了其对DNA的亲和性，亲和能力提高可达100倍。另外，双菁类探针本身没有荧光，但是嵌入DNA后荧光增强100-1000倍，属已知最强最亮的一类核酸显影剂之一，它们的灵敏度甚至达到可以显影单个DNA链(Science 264, 822 (1994))。
双菁类探针也包含10个家族成员，它们的显影荧光也可覆盖所有可见光光谱范围，从456nm(PoPo-1)到660nm(ToTo-3)，因此从它们中总能找到一个谱段合适的探针。双菁类探针难于透过细胞膜，适用于已固定细胞的细胞核对染(counterstaining)，可用于流式细胞仪或者荧光显微镜实验。双菁类探针也用于琼脂糖胶核酸显影。
PoPo-3与核酸或细胞核结合后显黄色荧光(ex/em ~ 534/570 nm)。
消光系数(ε) : 146400 cm−1M−1
量子产率(Φ) : 0.46
双菁类探针也包含10个家族成员，它们的显影荧光也可覆盖所有可见光光谱范围，从456nm(PoPo-1)到660nm(ToTo-3)，因此从它们中总能找到一个谱段合适的探针。双菁类探针难于透过细胞膜，适用于已固定细胞的细胞核对染(counterstaining)，可用于流式细胞仪或者荧光显微镜实验。双菁类探针也用于琼脂糖胶核酸显影。
PoPo-3与核酸或细胞核结合后显黄色荧光(ex/em ~ 534/570 nm)。
化学性质
ex/em : 534/570 nm消光系数(ε) : 146400 cm−1M−1
量子产率(Φ) : 0.46