名称:Sulfo-Cyanine3.5 NHS ester
Sulfo-Cy3.5 NHS ester
Sulfo-Cyanine3.5 SE
中文名:磺酸基Cy3.5活性酯
CAS:2231670-91-8
分子式:C42H40N3K3O16S4
分子量:1088.33
纯 度:≥95%
外 观:深紫色固体
溶解性:溶于水,DMF,DMSO
Ex/Em:~678/695 nm
消光系数:250, 000 L?mol-1?cm-1
A280/Amax:18%
结构式:
保存与运输方法:
保存:-20°C避光干燥保存,2年有效。
运输:室温运输。
磺化Cy3.5 (sulfo Cyanine 3.5; sulfo Cy3.5) 是一种发红色荧光的花青素类荧光染料。磺化Cy3.5是磺化修饰过的Cy3.5,水溶性好,它在显影时可以用561nm或者594nm的激光束激发然后用 Texas Red? 或相似的滤片观察,所以也是一种非常常用的标记染料。磺化Cy3.5-NHS可以用来标记蛋白,抗体,多肽,核酸分子等。由于强水溶性加带电荷,磺化花青素标记的生物分子更稳定,不易产生疏水性聚集。NHS活化酯 (N-羟基琥珀酰亚胺酯,N-hydroxysuccinimide ester,succinimidyl ester)是生物标记反应中常用的活化基团。它活化Cy3.5分子中的羧基,让它可以和目标生物分子上的胺基(伯胺或者仲胺)反应生成稳定的酰胺键,从而把磺化Cy3.5分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白,抗体,多肽表面的常见官能团(来自于赖胺酸侧链),磺化Cy3.5-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基,只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和磺化Cy3.5-NHS反应。磺化Cy3.5-NHS活化酯的水溶性非常好,所以可以在水相的标记反应体系中直接使用,不需要有机溶剂助溶,特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy3.5水溶性极好,并且染料分子本身带电荷,标记到蛋白表面后不会引发疏水性蛋白聚集,提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy3.5-NHS也溶于甲醇,DMSO,DMF等有机溶剂,标记反应也可以在纯有机溶剂中进行。如需脂溶性Cy3.5染料,可选择普通花青素(cyanine),即Cy3.5-NHS活化酯( D10011 )。磺化Cy3.5-NHS标记后的产物Ex/Em是591nm/604nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Texas Red?,Alexa Fluor 594, BODIPY? TR, DyLight 594等。
注意事项:
NHS活化酯基团对湿度比较敏感,务必干燥保存产品。使用前产品需放到室温回温至少20分钟。
使用不含氨基的缓冲体系。比如磷酸钠缓冲液(PBS),Hepes缓冲液,碳酸氢钠缓冲液;或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液,比如Tris,甘氨酸等,它们会和Cy3.5上的伯胺竞争。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
标记反应不要放在强光下,因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂白(photobleaching)。
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