129030-36-0;Digoxigenin-11-dUTP
Digoxigenin-11-dUTP 是用于 DNA 而非 RNA 的非放射性标记。它是一种关键的分子生物学试剂,用于制备地高辛标记的DNA探针。
Digoxigenin-11-dUTP 是一种修饰的脱氧核苷酸:
dUTP部分:是合成DNA的基本构建单元之一(脱氧尿苷三磷酸)。
Digoxigenin部分:作为半抗原标记物。
“11-”连接臂:将地高辛连接到碱基上,以最小化对DNA聚合酶活性的干扰。
由于其标记对象是DNA,它被广泛应用于所有需要DNA探针的检测技术中:
原位杂交(特别是DNA原位杂交)
检测染色体/DNA序列:用于定位基因组中的特定DNA序列,如基因拷贝数变异、染色体上的基因定位(基因作图)、病毒DNA在细胞或组织中的检测等。
过程:通过酶促反应将Digoxigenin-11-dUTP掺入DNA探针。该探针与经变性处理的样品DNA杂交后,用抗地高辛抗体进行免疫检测。
Southern Blot
用于检测特定DNA序列的存在、大小和拷贝数。
用地高辛标记的DNA探针与固定在膜上的基因组DNA进行杂交,通过化学发光或显色法检测。这是放射性同位素标记的常用替代方案。
DNA微阵列/CGH(比较基因组杂交)
用于基因分型或检测DNA拷贝数变化。样品DNA(如肿瘤基因组DNA)可以用Digoxigenin-11-dUTP标记,然后与芯片上的探针杂交。
荧光原位杂交
虽然FISH常用直接荧光标记,但地高辛标记的探针与偶联了荧光染料的抗地高辛抗体结合,也是一种有效的间接FISH策略,尤其适用于信号扩增或多色检测。
与UTP用于RNA聚合酶不同,dUTP需要被DNA聚合酶识别和利用。主要掺入方法有:
缺口平移:传统方法,使用DNase I和DNA聚合酶I在DNA链上制造缺口并替换核苷酸,掺入标记的dUTP。
随机引物标记:更常用的高效方法。使用随机六聚体引物和Klenow片段(DNA聚合酶I的大片段),以变性DNA为模板,合成含有标记dUTP的新链。
PCR标记:最便捷的方法。在PCR反应体系中,将一定比例的普通dTTP替换为Digoxigenin-11-dUTP,Taq DNA聚合酶会将其掺入到扩增产物中,从而直接得到标记的DNA探针。
末端标记:使用末端脱氧核苷酸转移酶 在DNA片段的3‘端添加一个或多个标记的dUTP,适用于标记寡核苷酸探针。
与Digoxigenin-11-UTP完全相同:
探针与靶标DNA杂交。
用抗地高辛抗体(偶联碱性磷酸酶AP或辣根过氧化物酶HRP)结合。
通过酶促底物产生:
化学发光信号(如CSPD for AP;ECL for HRP):用于印迹杂交,灵敏度极高。
显色信号(如NBT/BCIP for AP;DAB for HRP):用于原位杂交或印迹杂交,可直接肉眼或光学显微镜观察。
安全性:替代放射性³²P-dCTP。
高稳定性:探针可长期保存。
高灵敏度与低背景:免疫检测系统特异性强。
多功能性:适用于从膜杂交到原位检测的所有DNA分析技术。
核心结论:Digoxigenin-11-dUTP 是专门用于将地高辛半抗原标记掺入到DNA分子中的底物。它是制备非放射性DNA探针的核心试剂,广泛应用于检测和定位特定DNA序列的各种分子生物学技术中,是基因组研究、病理诊断和基础研究的重要工具。选择使用dUTP还是UTP,完全取决于您需要标记和检测的对象是DNA还是RNA。
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