原理: 利用高温(通常为95℃-100℃)破坏细胞膜和病毒衣壳,使内部的RNA释放出来。同时,高温也能使大部分蛋白(包括降解RNA的酶)变性失活。
核心局限:
无保护环境: 普通水中含有RNase,且缺乏RNase抑制剂(如β-巯基乙醇、异硫氰酸胍等),提取出的RNA极易在煮沸后的冷却过程中被降解。
纯度低: 此法无法去除蛋白质、DNA和多糖等杂质,提取液通常呈浑浊状。
适用场景:
病毒检测: 针对结构稳定的病毒(如新冠病毒、肠道病毒),且后续检测手段灵敏度较高(如RT-PCR)。
粗提: 仅用于快速筛查,不适用于需要高纯度RNA的实验(如转录组测序、Northern Blot)。
2. 所谓的“提取液”是什么?

在“水煮法”中,所谓的“提取液”通常不是一种复杂的商业试剂,而是简单的缓冲液或纯水:
无菌双蒸水 (ddHO): 最简单的提取液。
TE缓冲液 (Tris-EDTA): 比水略好,Tris维持pH值,EDTA螯合金属离子,能在一定程度上保护核酸。
裂解缓冲液: 部分改良的“水煮法”会使用含SDS(十二烷基硫酸钠)或NaOH的溶液,这已接近“碱裂解法”,比单纯用水效果更好。
3. 标准操作流程 (简易版)

如果你必须使用水煮法提取RNA(例如在缺乏Trizol试剂的紧急情况下),请参考以下步骤:
样本采集:
细胞/组织: 取少量细胞沉淀或组织块(<10mg)放入无RNA酶的EP管中。
病毒/拭子: 将咽拭子/鼻拭子放入保存液中反复震荡洗脱。
洗涤(可选): 加入PBS缓冲液洗涤一次,去除杂质,离心弃上清。
重悬: 加入 50-100 μL 无菌水 或 TE缓冲液。
水煮(裂解):
将EP管放入沸水浴或金属浴中。
温度: 95℃ - 100℃。
时间: 5 - 10 分钟。
离心:
取出EP管,短暂离心(12000g,5分钟)。
此时管底会有白色沉淀(变性的蛋白和细胞碎片)。
取上清:
小心吸取上清液(约40-80 μL),转移至新的无RNA酶EP管中。
注意: 不要吸到管底的沉淀,沉淀中含有抑制PCR反应的杂质。
直接使用: 提取的上清液可直接作为模板用于RT-PCR或荧光定量PCR反应。
4. 关键注意事项

现提现用: 水煮法提取的RNA极其不稳定,必须在提取后立即进行PCR扩增,严禁长期保存。
容器要求: 必须使用经DEPC水处理或高压灭菌过的无RNA酶枪头和EP管。
抑制剂问题: 水煮法提取的液体中可能含有血红蛋白、肝素等PCR抑制剂,如果PCR结果异常,可能是提取液纯度不够。
与Trizol法对比: 如果你需要做定量PCR(qPCR)且要求数据精准,或者提取组织/细胞中的内源性基因表达,请务必使用Trizol法,不要使用水煮法。
5. 总结
所谓的“RNA提取液(水煮法)”本质上是利用高温物理裂解结合简单的水溶液来释放RNA。它是一种快速、粗放的前处理手段,优点是速度快、成本低;缺点是RNA易降解、杂质多。