4-氨基-2,6-二甲氧基嘧啶是重要的医药和农药中间体,可用作磺胺类药物中间体。磺胺类药物属于属于广谱抗菌消炎药,能够用于预防和治疗细菌感染性疾病。磺胺莫托辛又称制菌磺,是磺胺类药物一种,4-氨基-2,6-二甲氧基嘧啶为其常用制备中间体之一。4-氨基-2,6-二甲氧基嘧啶是一种可被多氯化的化合物。它也是(磺胺二甲氧嘧啶EP杂质A)磺胺二甲氧嘧啶的杂质,磺胺二甲氧嘧啶是一种新出现的令人关注的污染物。
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