产品名称:海藻百伯史坦菌PCR检测试剂盒
英文名称:Bibersteinia trehalosiPCR
货号:YS-P013900
分类:PCR检测试剂盒
规格:50T/盒
检测原理:
靶向海藻百伯史坦菌特异性海藻代谢基因引物,区分海洋其他共生细菌。
海水样本滤膜吸附富集细菌,试剂盒裂解液直接处理滤膜提取核酸。
16S 内参同步扩增,校正海水样本核酸提取效率不足问题。
实验流程:
(一)反应体系配制(冰上操作,防酶失活与污染)
按 “水→缓冲液→dNTP→引物→模板→Taq 酶” 顺序加样(酶最后加,避免失活)。
轻轻涡旋混匀,短暂离心(3000rpm,10s),使液体沉至管底。
无热盖的 PCR 仪:加 1 滴矿物油覆盖液面,防止蒸发。
(二)PCR 程序设置(标准 35 循环)
预变性:94℃,3-5min(彻底变性模板 DNA)。
循环阶段(35 次):
变性:94℃,30s(双链解链)。
退火:55-65℃,30s(引物结合模板,按引物 Tm 值调整)。
延伸:72℃,1min/kb(Taq 酶合成新链,1kb 片段约 1min)。
终延伸:72℃,5-10min(确保片段完整延伸)。
保温:4℃,∞(防止非特异性复性,短期保存)。
(三)产物检测(琼脂糖凝胶电泳)
制胶:1% 琼脂糖凝胶(1g 琼脂糖 + 100mL 1×TAE 缓冲液),加热融化后加核酸染料,倒胶插梳,凝固 30min。
上样:取 5μL PCR 产物 + 1μL 上样缓冲液,点样;同时加 DNA Marker(分子量对照)。
电泳:120V,20-30min,至溴酚蓝迁移至凝胶 2/3 处。
成像:凝胶成像系统观察条带,目标片段位置与预期一致则为阳性。
四、参数优化
退火温度(Tm):引物 Tm 值 = 4×(G+C)+2×(A+T),退火温度一般低于 Tm 值 5℃,温度过高无条带,过低非特异性条带多。
Mg²⁺浓度:1.5-2.5mM,浓度过低酶活性低、产量少;过高非特异性扩增增加。
循环数:25-35 个循环,少于 25 个产物不足,多于 35 个易出现非特异性条带。
延伸时间:按目标片段长度调整,≤1kb 用 1min,1-3kb 用 2-3min。
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注意事项:
分区操作:试剂配制、样品处理、PCR扩增需在独立区域进行,避免交叉污染
无菌操作:使用带滤芯枪头、一次性手套和专用工作服
试剂准备:所有试剂使用前需完全融化,震荡混匀后短暂离心
避光保存:含荧光探针的试剂需避光保存和操作
防止污染:阳性对照操作需最后进行,实验后用10%次氯酸或75%酒精消毒工作台
关键字: 海藻百伯史坦菌;PCR检测试剂盒;
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