1267539-32-1

中文名称 Cy5-叠氮

英文名称 Cyanine5 azide

CAS 1267539-32-1

分子式 C35H45ClN6O

分子量 601.24

MOL 文件 1267539-32-1.mol

更新日期 2025/06/21 15:10:39

1267539-32-1 结构式

基本信息物理化学性质常见问题列表

基本信息

中文别名

花青5叠氮化物
花菁染料CY5叠氮
花菁染料叠氮 CY5 AZIDE
2-(5-(1-(6-((3-叠氮丙基)氨基)-6-氧代己基)-3,3-二甲基吲哚-2-亚基)戊-1,3-二烯-1-基)-1,3,3-三甲基-3H-吲哚-1-鎓氯化物

英文别名

Cyanine5 azide

所属类别

材料化学：发光材料

物理化学性质

外观性状外观 : 深蓝色固体
ex/em : 640/664 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 250000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.2

溶解度Soluble in DMSO, DMF, DCM

形态Solid

颜色Light brown to brown

外观Dark blue solid

ε(消光系数)250000 L⋅mol−1⋅cm−1

Φ(量子产率)0.2

激发峰(Ex)/发射峰(Em)640/664 nm (PBS buffer)

常见问题列表

概述

Cy5-叠氮是一种有效的荧光染料。Cyanine5 azide chloride 可通过铜催化点击反应 (CuAAC) 与末端炔烃反应。(λex=646 nm, λem=662 nm)。它含有 Azide 基团，可以和含有 Alkyne 基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应（CuAAc)。它还可以和含有 DBCO 或 BCN 基团的分子发生环张力促进的炔-叠氮环加成反应 (SPAAC)。

荧光标记染料

Cy5 (Cyanine 5) 是一种发远红(far-red)荧光的花青素荧光染料。它的消光系数很高，荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激发然后用 Cy5或APC滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。Cy5荧光落在远红光区，使用Cy5或者其它远红光染料的一个重要优势是在这个长波长光谱范围内样品背景荧光较低，而在这个区域CCD相机/检测器检测灵敏度最高。Cy5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子，纳米粒等。
叠氮(azide)是常用生物标记基团。通过点击化学反应(click chemistry)，叠氮可以和一系列炔烃(alkyne)或环炔烃(strained alkyne)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速定量完成(几乎100%产率)，即使在低浓度(μM)和低温(4oC)下也可完成。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。
Cy5标记后的产物Ex/Em是640/664nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。

注意事项

Cy5-叠氮水溶性较低，如需在水相中标记可选择磺化Cy5-叠氮。
叠氮化合物可被强还原剂(如DTT)还原破坏，使用时务必去除还原剂。
标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。