1481447-40-8
中文名称
磺化Cy5-叠氮
英文名称
3H-IndoliuM, 2-[5-[1-[6-[(3-azidopropyl)aMino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-diMethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1,3,3-triMethyl-5-sulfo-, inner salt
CAS
1481447-40-8
分子式
C35H44N6O7S2
分子量
724.89
MOL 文件
1481447-40-8.mol
更新日期
2025/10/27 15:30:00
1481447-40-8 结构式
基本信息
中文别名
磺化CY5-叠氮二磺酸-CY5-叠氮
英文别名
CY3-N3Cy5-N3
Sulfo-Cy5-N3
Sulfo-Cy5-N3, >97%
3H-IndoliuM, 2-[5-[1-[6-[(3-azidopropyl)aMino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-diMethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1,3,3-triMethyl-5-sulfo-, inner salt
所属类别
生物化工：荧光成像物理化学性质
外观性状外观 : 深蓝色固体
ex/em : 649/672 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 271000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.28
ex/em : 649/672 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 271000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.28
储存条件-20°C, protect from light
溶解度易溶于甲醇，DMF等有机溶剂，极易溶于水
形态Solid
颜色Brown to dark brown
外观Dark blue solid
ε(消光系数)271000 L⋅mol−1⋅cm−1
Φ(量子产率)0.28
激发峰(Ex)/发射峰(Em)649/672 nm (PBS buffer)
常见问题列表
概述
磺化Cy5-叠氮 是一种含有叠氮基的点击化学试剂。Cy5 是用于成像的红色荧光标记染料 (Ex/Em=642/670 nm)。它含有 Azide 基团，可以和含有 Alkyne 基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应（CuAAc)。它还可以和含有 DBCO 或 BCN 基团的分子发生环张力促进的炔-叠氮环加成反应 (SPAAC)。荧光标记染料
磺化Cy5是Cy5(Cyanine 5)的水溶型。它的光谱性质和Cy5类似，在荧光显微镜下发远红色荧光。它荧光亮，对pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激发然后用 Cy5或APC滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。磺化Cy5荧光落在远红光区，使用磺化Cy5或者其它远红光染料的一个重要优势是在这个长波长光谱范围内样品背景荧光较低，而在这个区域CCD相机/检测器检测灵敏度最高。磺化Cy5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子等。磺化Cy5水溶性非常好，可在水相标记反应体系中直接使用，不需要有机溶剂助溶，特别适合标记对有机溶剂敏感的生物分子。另外由于强水溶性加染料分子本身带电荷，磺化Cy5标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。
叠氮(azide)是常用生物标记基团。通过点击化学反应(click chemistry)，叠氮可以和一系列炔烃(alkyne)或环炔烃(strained alkyne)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速定量完成(几乎100%产率)，即使在低浓度(μM)和低温(4oC)下也可完成。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。
磺化Cy5标记后的产物Ex/Em是649/672nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。
注意事项
- 磺化Cy5水溶性高，极性强，如需脂溶性标记染料，请选择普通Cy5-叠氮。
- 叠氮化合物可被强还原剂(如DTT)还原破坏，使用时务必去除还原剂。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。