1782950-79-1
中文名称
Cy3 DBCO
英文名称
Cy3 DBCO
CAS
1782950-79-1
分子式
C50H54N4O11S3
分子量
983.18
MOL 文件
1782950-79-1.mol
更新日期
2025/07/30 15:03:50
1782950-79-1 结构式
基本信息
中文别名
磺化CY3-DBCODBCO-磺基-CY3
氰基CY3二苯基环辛炔
磺化CY3二苯基环辛炔
菁染料CY3二苯基环辛炔
水溶性CY3二苯基环辛炔
磺酸-CY3-二苯并环辛炔
三磺酸基CY3-二苯基环辛炔
水溶性菁染料CY3 DBCO
三磺酸-CY3-二苯并环辛炔
英文别名
Cy3 DBCODBCO-Sulfo-Cy3
Sulfo-Cy3 DBCO
所属类别
化学试剂：有机试剂物理化学性质
外观性状外观 : 红色粉末
ex/em : 550/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 162000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.1
ex/em : 550/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 162000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.1
溶解度Soluble in Water, DMSO, DMF, DCM
形态Solid
颜色Purple to purplish red
外观Red powder
ε(消光系数)162000 L⋅mol−1⋅cm−1
Φ(量子产率)0.1
激发峰(Ex)/发射峰(Em)550/566 nm (PBS buffer)
InChIKeyALLGTQOHAQKUOH-UHFFFAOYSA-N
SMILESC([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C12)C=CC=C1C(C2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=C2N1CCCCCC(=O)NCCC(N1CC2=CC=CC=C2C#CC2=CC=CC=C12)=O)(C)C)CCS(O)(=O)=O
常见问题列表
荧光标记染料
磺化Cy3是Cy3(Cyanine 3)的水溶型。它的光谱性质和Cy3类似，在荧光显微镜下发橘黄色荧光。它的荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后，样品背景荧光一般认为比TAMRA等系列的染料低。磺化Cy3可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸等各种生物分子。磺化Cy3水溶性非常好，可在水相标记反应体系中直接使用，不需要有机溶剂助溶，特别适合标记对有机溶剂敏感的生物分子。另外由于强水溶性加染料分子本身带电荷，磺化Cy3标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。
DBCO(dibenzocyclooctyne, DIBAC)是常用点击化学生物标记基团。在无铜点击化学(copper-free click chemistry)中，DBCO是最常用的张环辛炔，它反应快(二级速率常数：0.3 to 0.9 M-1s-1)，效率高，适合对蛋白，细胞，动物体内生物标记。无铜点击化学标记简单易行，反应选择性高，无铜离子干扰(铜离子螯合沉淀蛋白，细胞毒性等)，试剂消耗小，特别适合复杂体系的荧光标记。
磺化Cy3标记后的产物Ex/Em是550/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
注意事项
- 磺化Cy3水溶性高，极性强，本产品可以水相直接反应标记。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
生物活性
DBCO-Cy3 (DBCO-Sulfo-Cy3) 是 Cyanine3 fluorophore 的衍生物，是一种 pH (4-10) 不敏感的橙红色荧光染料 (orange fluorescent dye)，激发波长和发射波长分别为 555 nm 和 580 nm。Sulfo-Cy3 DBCO 反应动力学快，稳定性好，可用于多种标准荧光仪器。靶点
Orange fluorescent dye
体外研究
DBCO-Cy3 exhibits less background than TAMRA and most other commonly used fluorescent dyes.DBCO-Cy3 can be conjugated to antibodies, peptides, and proteins, it can be excited using the 532 nm or 555 nm laser line and visualized with TRITC filter sets.