通过电泳技术，可以分离出不同大小和构象的RNA分子，并通过观察条带的数量、大小和形态，可以判断出RNA分子的完整性。而在这个过程中，电泳缓冲液的主要作用就是保持pH，并使溶液具有一定的导电性。TAE（Tris-乙酸缓冲液）和TBE（TRIS-硼酸电泳缓冲液）是比较常用的缓冲液，它们到底有什么区别呢？
TAE（Tris-乙酸缓冲液）
优点：
①对于大于13kb的DNA片段，TAE缓冲液能取得更好的分离效果。
②在TAE缓冲液中，DNA的超螺旋状态在电泳过程中能够更好地保持其真实的相对分子质量。
③适用于回收DNA片段，后续进行酶切反应等
缺点：
缓冲容量小，TAE缓冲液在长时间电泳过程中可能会逐渐失去其pH缓冲能力，导致pH值发生变化。
TBE（TRIS-硼酸电泳缓冲液）
优点：
①缓冲能力相对更强，即使在长时间电泳过程中也能保持pH值的恒定，且不容易导致电泳槽内过热。
②适用于电泳分离较小的片段，如小于1kb的片段。其高分辨率使得不同大小的分子更容易区分，从而提高实验的准确性。
缺点：
含有的硼酸成分，可能会对RNA、DNA的回收效率和后续的酶反应实验产生影响。