考马斯蓝 R250 是一种阴离子染料，可以和蛋白质结合，可用于定量蛋白质的相对丰度，也可用于（2-DE）凝胶的差异表达分析。虽然考马斯蓝染色的灵敏度比银染色低50倍，但考马斯蓝染色是一种相对简单且定量性更高的方法。方法就是将凝胶浸泡在染料溶液中。在脱色步骤中，未与蛋白质结合的染料会从凝胶中扩散出来。蛋白质在透明背景上被检测为蓝点或条带。该方法可用于1-DE和2-DE之后的蛋白质染色。该方法的检测范围为50-200ng蛋白质。
配制方法
配制1L的考马斯亮蓝染色溶液：将1g考马斯R250溶解到300ml甲醇中。然后加入650毫升dd水和50毫升乙酸。在无磁搅拌器上搅拌溶液2小时。该溶液可以通过滤纸过滤以去除不溶性染料。该溶液可在20ºC下储存数月。
注意事项
使用过程请戴好一次性手套，做好防护。
回收用染色液请单独存放，勿与未使用染色液混合。
如果染色液混浊或含有沉淀物，请勿使用。包括颜色、pH变化或物理特性的变化可能会影响产品使用效果。
使用过程中染色液如洒漏桌面，可用酒精溶液擦拭干净。