YODi-1，DNA和染色质复染剂
| 中文名称 | YODi-1，DNA和染色质复染剂 |
|---|---|
| 中文同义词 | 死细胞核染料 DIYO -1;3-[二甲基-[3-[4-[(E)-(3-甲基-1,3-苯并恶唑-2-亚基)甲基]喹啉-1-鎓-1-基]丙基]铵基]丙基-二甲基-[3-[4-[(E)-(3-甲基-1,3-苯并恶唑-2-亚基)甲基]喹啉-1-鎓-1-基]丙基]铵四碘化物;噻唑橙色二聚体YOYO1;YOYO*-1 EQUIVALENT,DNA和染色质复染剂;YOYO 1 Green Fluorescent Dye (5 mM in DMSO) 死细胞核染料;YOYO 1 Green Fluorescent Dye (5 mM in DMSO) 死细胞核染料;YOYO 1 绿色荧光染料;YODi-1,绿色荧光核酸染料 (YODi-1, green fluorescent nucleic acid stain) |
| 英文名称 | 2-([1-(3-[[3-(DIMETHYL(3-[4-[(E)-(3-METHYL-1,3-BENZOXAZOL-3-IUM-2-YL)METHYLIDENE]-1(4H)-QUINOLINYL]PROPYL)AMMONIO)PROPYL](DIMETHYL)AMMONIO]PROPYL)-4(1H)-QUINOLINYLIDENE]METHYL)-3-METHYL-1,3-BENZOXAZOL-3-IUM TETRAIODIDE |
| 英文同义词 | QUINOLINIUM, 1,1'-[1,3-PROPANEDIYLBIS[(DIMETHYLIMINIO)-3,1-PROPANEDIYL]]BIS[4-[(3-METHYL-2(3H)-BENZOXAZOLYLIDENE)METHYL]-, TETRAIODIDE;YOYO 1;1,1’-((4,4,7,7-tetramethyl)-4,7-diazaundecamethylene)bis-4-(3-methyl-2,3-dihydr;2-([1-(3-[[3-(DIMETHYL(3-[4-[(E)-(3-METHYL-1,3-BENZOXAZOL-3-IUM-2-YL)METHYLIDENE]-1(4H)-QUINOLINYL]PROPYL)AMMONIO)PROPYL](DIMETHYL)AMMONIO]PROPYL)-4(1H)-QUINOLINYLIDENE]METHYL)-3-METHYL-1,3-BENZOXAZOL-3-IUM TETRAIODIDE;o(benzo-1,3-oxazole)-2-methylidene)quinolinium;1,1'-((4,4,7,7-tetramethyl)-4,7-diazaundecamethylene)bis-4-(3-methyl-2,3-dihydro(benzo-1,3-oxazole)-2-methylidene)quinolinium;1,1'-((4,4,7,7-Tetramethyl)-4,7-diazaundecamethylene)bis-4-(3-methyl-2,3-dihydro(benzo-1,3-oxazole)-2-methylidene)quinolinium tetraiodide;1,1'-(1,3-Propanediylbis((dimethyliminio)-3,1-propanediyl))bis(4-(3-methyl-2(3H)-benzoxazolylidene)methyl)quinolinium tetraiodide |
| CAS号 | 143413-85-8 |
| 分子式 | C49H58IN6O2+3 |
| 分子量 | 889.95 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | Cyanine |
| Mol文件 | 143413-85-8.mol |
| 结构式 |  |
YODi-1，DNA和染色质复染剂 性质
| 熔点 | >250 ℃ |
|---|---|
| 溶解度 | 溶于二甲亚砜、水 |
| 形态 | 粉末 |
| 颜色 | 橙红色 |
| 外观 | orange solution |
| 最大波长(λmax) | 491 nm |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 491/509 nm |
| ε(消光系数) | 98900 cm−1M−1 |
| Φ(量子产率) | 0.52 |
| 生物领域应用 | Nucleic acid hybridization; nucleic acid sequencing; detecting nucleic acids,cells,human papilloma virus (HPV),pathogens,spores,cancer cells,stress biomarkers,viruses |
Thiazole orange dimer YOYO 1 是一种用于 DNA 染色的绿色荧光染料。它属于一甲碱花青染料家族，是恶唑黄 (缩写为 YO，因此得名 YOYO) 的四阳离子同二聚体，通常以四碘盐形式提供。在水性缓冲液中，游离的 YOYO-1 染料 (λmax 458 nm; λmax 564 nm) 具有非常低的荧光量子产率，但通过双嵌入结合到双链 DNA 后，荧光强度增加了 3200 倍 (λmax 489 nm; λmax 509 nm)。YoYo-1是高灵敏核酸显影剂，常用于细胞核显影。尤尤-1是尤普若-1(YO-PRO-1)的二连体(dimer)，属双菁类(Cyanine dimers)荧光探针。双菁类探针由两个单菁染料分子(一般来自托普家族，TO-PRO family)对称链接而成，共带4个正电荷。这个结构大大增强了其对DNA的亲和性，亲和能力提高可达100倍。另外，双菁类探针本身没有荧光，但是嵌入DNA后荧光增强100-1000倍，属已知最强最亮的一类核酸显影剂之一，它们的灵敏度甚至达到可以显影单个DNA链(Science 264, 822 (1994))。
双菁类探针也包含10个家族成员，它们的显影荧光也可覆盖所有可见光光谱范围，从456nm(PoPo-1)到660nm(ToTo-3)，因此从它们中总能找到一个谱段合适的探针。双菁类探针难于透过细胞膜，适用于已固定细胞的细胞核对染(counterstaining)，可用于流式细胞仪或者荧光显微镜实验。双菁类探针也用于琼脂糖胶核酸显影。
YoYo-1与核酸或细胞核结合后显绿色荧光(ex/em ~ 491/509 nm)。
消光系数(ε) : 98900 cm−1M−1
量子产率(Φ) : 0.52
双菁类探针也包含10个家族成员，它们的显影荧光也可覆盖所有可见光光谱范围，从456nm(PoPo-1)到660nm(ToTo-3)，因此从它们中总能找到一个谱段合适的探针。双菁类探针难于透过细胞膜，适用于已固定细胞的细胞核对染(counterstaining)，可用于流式细胞仪或者荧光显微镜实验。双菁类探针也用于琼脂糖胶核酸显影。
YoYo-1与核酸或细胞核结合后显绿色荧光(ex/em ~ 491/509 nm)。
化学性质
ex/em : 491/509 nm消光系数(ε) : 98900 cm−1M−1
量子产率(Φ) : 0.52