3H-Indolium, 3-(5-carboxypentyl)-2-[3-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3) (9CI)
| 中文名称 | 3H-Indolium, 3-(5-carboxypentyl)-2-[3-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3) (9CI) |
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| 中文同义词 | |
| 英文名称 | 3H-Indolium, 3-(5-carboxypentyl)-2-[3-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3) (9CI) |
| 英文同义词 | 3H-Indolium, 3-(5-carboxypentyl)-2-[3-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3) (9CI);AF 555 carboxylic acid, TEA salt;3H-Indolium, 3-(5-carboxypentyl)-2-[3-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethana |
| CAS号 | 407627-67-2 |
| 分子式 | C40H59N3O14S4 |
| 分子量 | 934.16 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | |
| Mol文件 | 407627-67-2.mol |
| 结构式 | ![3H-Indolium, 3-(5-carboxypentyl)-2-[3-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3) (9CI) 结构式](CAS/20211123/GIF/407627-67-2.gif) |
3H-Indolium, 3-(5-carboxypentyl)-2-[3-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3) (9CI) 性质
| 溶解度 | 易溶于DMSO, DMF, 水等 |
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| 外观 | Red solid |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 556/571 nm |
| ε(消光系数) | 155,000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.10 |
3H-Indolium, 3-(5-carboxypentyl)-2-[3-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3) (9CI) 用途与合成方法
AF555，即Alexa Flour 555，是Alexa Fluor家族中的一种橘黄色-橙红色荧光染料，是Sulfo-Cy3的类似物，常用于代替Cy3、TAMRA染料使用。AF555染料的激发谱和发射谱具有较好的对称性，并且都有非常典型的肩峰，激发谱的肩峰巧合处于532nm激光束附近，在共聚焦实验中常常被用于激发AF555染料。AF555染料的激发峰和发射峰谱带恰好处于黄色光与红色光过度区域，因此，激发光往往呈黄色或者黄绿色，发射出来的荧光为黄红色（橙红色），这种荧光色彩和AF488的绿色荧光一样，都是人肉眼非常敏感的彩色光，在荧光显微镜下很容易辨认出来。
AF555染料的极性很大，水溶性极强，荧光亮度和荧光稳定性也极好，是蛋白/抗体标记的良好染料。从化学结构上看，AF555的母核是花青素Cy3，但是母核上带有多达4个磺酸根基团，相对于二磺酸的sulfo-Cy3，足足多了一倍。 AF555染料的四磺酸结构让其具有极度亲水性，染料标记到蛋白表面后，不会改变蛋白表面极性，降低了蛋白疏水化聚集沉淀的风险；磺酸根带有多电荷，这让蛋白表面标记的多个AF555分子间互相电荷排斥，极大降低了染料局部靠近而荧光淬灭的概率，因此AF555标记后的蛋白往往发出更强的荧光，亮度比sulfo-Cy3标记的样品要强20%以上。
本产品是AF555羧酸
ex/em : 556/571 nm
消光系数(ε) : 155,000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.10
AF555染料的极性很大，水溶性极强，荧光亮度和荧光稳定性也极好，是蛋白/抗体标记的良好染料。从化学结构上看，AF555的母核是花青素Cy3，但是母核上带有多达4个磺酸根基团，相对于二磺酸的sulfo-Cy3，足足多了一倍。 AF555染料的四磺酸结构让其具有极度亲水性，染料标记到蛋白表面后，不会改变蛋白表面极性，降低了蛋白疏水化聚集沉淀的风险；磺酸根带有多电荷，这让蛋白表面标记的多个AF555分子间互相电荷排斥，极大降低了染料局部靠近而荧光淬灭的概率，因此AF555标记后的蛋白往往发出更强的荧光，亮度比sulfo-Cy3标记的样品要强20%以上。
本产品是AF555羧酸
化学性质
外观 : 红色固体ex/em : 556/571 nm
消光系数(ε) : 155,000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.10