曼那角病毒染料法荧光定量RT-PCR试剂盒
商品属性
产品名称 | 曼那角病毒染料法荧光定量RT-PCR试剂盒 | 英文名称 | Manawa Virus Dye-based qRT-PCR Kit |
规格 | 50T | 货号 | PR3392 |
预期用途
本试剂盒利用荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术,结合特异性引物和DNA结合染料(如SYBR Green I或EvaGreen等),用于体外定性检测人血清、血浆或蚊虫样本中曼那角病毒(马亚罗病毒,MAYV)的RNA。
检测原理
RNA提取: 从待测样本中提取病毒RNA(本试剂盒通常不包含RNA提取组分,需单独准备)。
逆转录 (RT): 在反应体系中,逆转录酶以病毒RNA为模板,在特异性下游引物或随机引物/寡聚dT引物的引导下,合成互补的cDNA链。
荧光定量PCR (qPCR): 以cDNA为模板,在热稳定DNA聚合酶的作用下,利用针对曼那角病毒基因组保守区域(通常是非结构蛋白基因如nsP1或结构蛋白基因如E2/E1)设计的特异性引物进行扩增。
荧光检测: 反应体系中包含能嵌入双链DNA(dsDNA)的荧光染料(如SYBR Green I)。在PCR扩增过程中,随着目标产物的积累,荧光染料与dsDNA结合的量增加,导致荧光信号增强。仪器实时监测每个循环结束时的荧光强度。
结果判定: 通过分析荧光信号达到预设阈值(Ct值)所需的循环数,结合阳性/阴性对照,判断样本中是否存在曼那角病毒RNA。熔解曲线分析(Melting Curve Analysis)可用于验证扩增产物的特异性(单一峰形)和区分非特异性扩增或引物二聚体。
锐器盒。
样本要求
样本类型: 人血清、血浆、蚊虫匀浆上清液等。其他样本类型请参考文献或咨询厂商确认适用性。
采集与运输: 按标准生物样本采集规范操作。血清/血浆样本建议在2-8°C下运输,长期保存应置于-70°C或更低温度。避免反复冻融。
RNA提取: 使用合适的RNA提取试剂盒严格按照说明书操作。提取的RNA应尽快用于RT-qPCR检测,或保存于-70°C/-80°C。避免RNA酶污染。
操作步骤
重要提示: 操作全程应在洁净环境中进行,严格分区(试剂准备区、样本处理/加样区、扩增/检测区),避免污染。使用带滤芯吸头。所有试剂使用前应充分解冻(置于冰上或室温),混匀并短暂离心。
1. 反应体系配制 (在试剂准备区)
计算: 根据待测样本数(n),加上阳性对照(1管)、阴性对照(1-2管)和可能需要的复孔,计算所需反应数(N)。
配制主混合液 (Master Mix):
每个反应所需体积:
2X RT-qPCR预混液: 10 µL
引物混合液: 2 µL
无核酸酶水: 3 µL
总体系:15 µL / 反应 (不含模板RNA)
在一个无菌无核酸酶的离心管中加入:
(N x 10 µL) 的 2X RT-qPCR预混液
(N x 2 µL) 的 引物混合液
(N x 3 µL) 的 无核酸酶水
轻轻涡旋混匀,短暂离心。
2. 分装与加样 (在样本处理区)
将配制好的主混合液分装至PCR反应管/板孔中,每孔15 µL。
加入模板RNA:
在相应孔中加入5 µL提取的待测样本RNA。
在阳性对照孔中加入5 µL 曼那角病毒阳性对照。
在阴性对照孔中加入5 µL 阴性对照。
盖紧管盖或封好反应板,短暂离心混匀并去除气泡。
3. RT-qPCR扩增与检测 (在扩增/检测区)
将反应管/板放入实时荧光定量PCR仪中。
设置并运行以下循环程序(示例,具体参数需优化,请参考厂商推荐或自行验证):
逆转录 (RT): 50°C 10 - 30 分钟 (1个循环)
预变性/热启动激活: 95°C 2 - 5 分钟 (1个循环)
PCR扩增 (40-45个循环):
变性: 95°C 10 - 15 秒
退火/延伸/荧光采集: 60°C 30 - 60 秒 (在此步骤结束时采集荧光信号 - SYBR Green通道)
熔解曲线分析 (可选但强烈推荐):
95°C 15 秒
60°C 1 分钟
缓慢升温至95°C (如0.3°C/秒),并连续采集荧光信号 (用于检测产物特异性)。
结果解释
质量控制:
阴性对照 (NC): 应无扩增曲线(Ct值 = Undetermined 或 > 40)或熔解曲线显示无特异性峰。
阳性对照 (PC): 应有典型的S型扩增曲线,Ct值应在预期范围内,熔解曲线显示单尖锐的特异性峰。
如果对照结果不符合要求,本次实验无效,需排查原因后重新实验。
样本结果判定 (定性):
阳性: 样本孔出现S型扩增曲线,且Ct值 ≤ 预设的Cut-off值(例如:Ct ≤ 38 或 40,需根据试剂盒验证和实验室SOP确定),并且熔解曲线峰形与阳性对照一致(单Tm值与阳性对照接近,通常在±1°C内)。
阴性: 样本孔无扩增曲线(Ct值 = Undetermined 或 > Cut-off值),或者虽有扩增曲线但熔解曲线峰形异常(如多峰、宽峰、Tm值与阳性对照差异显著),表明可能是非特异性扩增或引物二聚体,应判为阴性。
无效: 如果内参(如果使用)或质控失败,或结果无法明确判定,应判为无效,建议重复检测。
熔解曲线分析: 是染料法确认特异性的关键步骤。必须将样本的熔解曲线峰形和熔解温度(Tm值)与阳性对照进行比较,确保一致。
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关键字: 曼那角病毒;染料法荧光定量;PCR试剂盒;
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