检测目标
靶基因:
IS481序列(百日咳杆菌特异性插入重复序列,检测限1拷贝/μL)
ptxA基因(编码百日咳毒素启动子,区分野生株与疫苗株)
覆盖变异株:包括当前流行的ptxA1(毒性增强型)和ptxA3(疫苗逃逸型)。
方法原理
双重荧光PCR:
IS481-FAM探针(筛查) + ptxA-HEX探针(分型),内标(Cy5标记人RNase P基因)监控采样质量。
采用抗黏液聚合酶,适配鼻咽拭子(NP)等高黏度样本。
适用样本
临床:鼻咽拭子(首选)、痰液(成人患者)、支气管肺泡灌洗液(重症)
流行病学:疫苗接种后突破性感染病例的病原溯源
二、试剂盒组分与操作流程

1. 核心组分
组分 功能说明
RT-PCR预混液 含逆转录酶、热启动Taq酶、dUTP/UNG防污染系统
探针引物混合液 IS481-FAM/ptxA-HEX探针,内标(Cy5)
阳性对照 灭活BP Tohama I株(ATCC BAA-589)与ptxA1突变株混合RNA
核酸释放剂 含溶菌酶和Triton X-100,支持拭子直接裂解(免提取)
2. 操作步骤(以鼻咽拭子为例)
样本处理:拭子头浸入500μL释放剂,涡旋10秒,95℃加热5分钟灭活。
PCR扩增(20μL体系):
50℃ 15min(RT)→ 95℃ 3min → [95℃ 10s → 60℃ 30s]×40 cycles
结果判读:
IS481(FAM)Ct≤35 + ptxA(HEX)Ct≤38 → 野生株感染。
三、性能与质控

1. 关键参数
指标 性能标准 验证依据
灵敏度 100%检出(≥102 CFU/mL) WHO BP核酸标准品
特异性 不与副百日咳杆菌、支气管败血鲍特菌交叉 200例临床样本验证
抗干扰性 耐受30%鼻腔分泌物或抗生素(如阿奇霉素) 模拟临床样本测试
2. 质控要求
每批次检测需包含:
弱阳性对照(50 CFU/mL,监控检测下限)
阴性对照(生理盐水)
内标(Cy5 Ct值28-32)
四、注意事项

采样时效性
卡他期(发病1-2周)鼻咽拭子检出率>90%,恢复期推荐血清学补充检测。
生物安全
BP属BSL-2病原体,拭子需置于密闭运输管中(UN3373认证包装)。
局限性
疫苗接种7天内可能假阳性(死菌DNA残留),需结合培养验证。
五、应用场景

临床诊断:
婴幼儿阵发性咳嗽的病原确诊(区别于呼吸道合胞病毒/腺病毒感染)。
公卫监测:
疫苗接种覆盖率评估(检测ptxA3逃逸株流行趋势)。
院感防控:
新生儿病房医护人员带菌筛查
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