Cy3-dUTP (Cyanine 3-dUTP)在大多数情况下可以取代dTTP作为各种DNA合成酶、修饰酶、聚合酶,包括Taq DNA Polymerase、phi29 DNA Polymerase、Klenow Fragment, Exo-、Klenow Fragment、Terminal Deoxynucleotidyl Transferase 、DNA Polymerase I、逆转录酶等的底物,对DNA实现红色荧光标记。例如通过PCR生成Cy3标记DNA红色荧光探针,经凝胶电泳后,Cy3标记DNA的荧光在激发后清晰可见,无需进一步染色。由该方法生成的荧光标记探针适用于多种应用,如FISH、微阵列、印迹检测、多色荧光分析等。激发/发射波长分别为550/570nm。
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