背景及概述
二甲苯青FF，英文名为Xylene Cyanol FF，别称酸性蓝147、二甲苯蓝，是生物实验常用的三苯甲烷类酸性阴离子染料，CAS号为2650-17-1，分子式C₂₅H₂₇N₂NaO₆S₂，相对分子质量538.61。该物质拥有典型的三苯甲烷共轭发色体系，分子带有磺酸根阴离子基团，显色性能稳定，电泳迁移速率固定，是分子生物学核酸电泳实验中不可或缺的示踪染料，广泛应用于核酸检测、蛋白分析与组织染色领域。
性质
二甲苯青FF为暗绿至蓝黑色结晶粉末，极易溶于纯水，水溶液呈现通透的深蓝色，也可溶于甲醇、乙醇等极性醇类溶剂；几乎不溶于乙醚、丙酮等弱极性有机溶剂。作为酸性阴离子染料，二甲苯青 FF水溶液呈弱酸性，可与带正电的蛋白、核酸片段产生微弱静电作用。分子内大π共轭体系使其显色极为稳定，不易受光线、轻微酸碱波动影响而变色，抗干扰能力强。
图1 二甲苯青FF性状图
工业合成
采用三苯甲烷染料经典缩合工艺制备二甲苯青 FF[1]，以间甲基苯胺、苯甲醛衍生物为原料，在酸性催化条件下发生缩合反应，构建三苯甲烷共轭母核，再经磺化反应引入磺酸基团提升水溶性，最后钠盐化、重结晶提纯得到成品。该合成工艺成熟可控，染料纯度高，发色杂质少，能够满足生物实验高精度、低干扰的试剂使用标准。
用途
二甲苯青 FF是核酸电泳示踪指示剂，常与溴酚蓝复配制成上样缓冲液。二甲苯青FF电泳迁移速度慢于溴酚蓝，可标记大分子核酸片段，帮助实验人员直观判断电泳进程，避免核酸跑出凝胶造成样本损失。除此之外，它还可用于组织切片化学染色、金属离子分光光度检测，在生物科研、病理分析领域发挥关键作用。
参考文献
[1]Agnes, Richard S.; Jernigan, Finith; Shell, Jennifer R.; Sharma, Vyas; Lawrence, David S.Suborganelle sensing of mitochondrial cAMP-dependent protein kinase activity.[J]Journal of the American Chemical Society, 2010, vol. 132, # 17, p. 6075 - 6080, 10.1021/ja909652q.