水溶性Cy3-NH2
| 中文名称 | 水溶性Cy3-NH2 |
|---|---|
| 中文同义词 | 二磺酸-CY3-氨基;磺化CY3-伯胺;水溶性CY3-NH2;水溶性CY3 NH2/氨基;水溶性花青素3氨基,磺化CYANINE3氨基,SULFO-CY3 AMINE;水溶性花青素3氨基,磺化CYANINE3氨基;磺酸基菁CY3氨基;水溶性菁染料CY氨基 |
| 英文名称 | diSulfo-Cy3 amine |
| 英文同义词 | diSulfo-Cy3 amine;Sulfo CY3-NH2;Sulfo-Cyanine3 amine,Sulfo-Cy3 amine,Sulfo-Cyanine3 NH2;Sulfo-CY3.5-NH2 |
| CAS号 | 2183440-43-7 |
| 分子式 | C36H50N4O7S2 |
| 分子量 | 714.94 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 基准试剂;化学试剂;工具分子-染料;荧光染料 |
| Mol文件 | 2183440-43-7.mol |
| 结构式 |  |
水溶性Cy3-NH2 性质
| 溶解度 | 溶于水、醇、DMSO、DMF |
|---|---|
| 形态 | Solid |
| 颜色 | Brown to dark brown |
| 外观 | Red solid |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 550/566 nm (PBS buffer) |
| ε(消光系数) | 150000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.10 |
| InChIKey | ZVOZJQQPUBRDRD-UHFFFAOYSA-N |
| SMILES | C([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C12)C=CC=C1N(C2=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C2C1(C)C)C)CCCCC(=O)NCCCCCCN |
水溶性Cy3-NH2 是带有胺基团的 Cyanine 3 (Cy3) (HY-D0822) 染料衍生物。磺酸根离子增加了化合物的水溶性，使其适用于水性溶液。Cy3 是一种荧光染料，荧光光谱通常在绿色至橙色的波长范围内。Sulfo-Cy3 amine 的胺官能团可以与羧基反应，形成共价键。Sulfo-Cy3 amine 能够与蛋白质、抗体等生物分子结合，追踪它们在生物样品中的位置和动态变化。磺化Cy3是Cy3(Cyanine 3)的水溶型。它的光谱性质和Cy3类似，在荧光显微镜下发橘黄色荧光。它的荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后，样品背景荧光一般认为比TAMRA等系列的染料低。 磺化Cy3可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸等各种生物分子。
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接，从而把Cy3分子连接到目标分子上。
磺化Cy3-伯胺的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy3水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy3-伯胺也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行
磺化Cy3-伯胺标记后的产物Ex/Em是550/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
ex/em : 550/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 150000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.10
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接，从而把Cy3分子连接到目标分子上。
磺化Cy3-伯胺的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy3水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy3-伯胺也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行
磺化Cy3-伯胺标记后的产物Ex/Em是550/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
- 磺化Cy3水溶性高，极性强，如需脂溶性标记染料，请选择普通Cy3-伯胺。
- 标记时使用不含氨基的缓冲体系，比如磷酸钠缓冲液（PBS），Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液；或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等，它们会和磺化Cy3上的伯胺竞争。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
化学性质
外观 : 红色固体ex/em : 550/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 150000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.10