磺化Cy5-伯胺
| 中文名称 | 磺化Cy5-伯胺 |
|---|---|
| 中文同义词 | 二磺酸-CY5-氨基;水溶磺化CY5氨基,SULFO-CYANINE5 AMINE;磺化CY5-伯胺;磺化CY5-氨基;水溶性菁染料CY5氨基;水溶性CY5氨基;水溶性花菁染料CY5标记氨基 |
| 英文名称 | diSulfo-Cy5 amine |
| 英文同义词 | diSulfo-Cy5 amine;sulfo Cy5(Me) NH2.HCl;1-(6-((6-Aminohexyl)amino)-6-oxohexyl)-3,3-dimethyl-2-(5-(1,3,3-trimethyl-5-sulfoindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3H-indol-1-ium-5-sulfonate;Sulfo Cy5(N-Me) NH2.HCl;Sulfo-Cy5 amine（Methyl) |
| CAS号 | 2183440-44-8 |
| 分子式 | C38H52N4O7S2 |
| 分子量 | 740.98 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 基准试剂;化学试剂;小分子药物 |
| Mol文件 | 2183440-44-8.mol |
| 结构式 |  |
磺化Cy5-伯胺 性质
| 储存条件 | 2-8°C, sealed storage, away from moisture and light |
|---|---|
| 溶解度 | 溶于水、DMF、DMSO、醇类 |
| 形态 | 固体 |
| 颜色 | 棕至红棕色 |
| 外观 | Dark blue solid |
| ε(消光系数) | 271000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.28 |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 649/672 nm (PBS buffer) |
| InChIKey | YAAUASLQACUDFY-UHFFFAOYSA-N |
| SMILES | C([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C12)C=CC=CC=C1N(C2=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C2C1(C)C)C)CCCCC(=O)NCCCCCCN |
磺化Cy5-伯胺 是带有胺基团的 Cyanine 5 (Cy5) (HY-D0821) 染料衍生物。磺酸根离子增加了化合物的水溶性，使其适用于水性溶液。Cy5 是一种近红外荧光染料，通常用于生物标记和细胞成像。Sulfo-Cy5 amine 的胺官能团可以与羧基反应，形成共价键。Sulfo-Cy5 amine 能够与蛋白质、抗体等生物分子结合，追踪它们在生物样品中的位置和动态变化。磺化Cy5是Cy5(Cyanine 5)的水溶型。它的光谱性质和Cy5类似，在荧光显微镜下发远红色荧光。它荧光亮，对pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激发然后用 Cy5或APC滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。磺化Cy5荧光落在远红光区，使用磺化Cy5或者其它远红光染料的一个重要优势是在这个长波长光谱范围内样品背景荧光较低，而在这个区域CCD相机/检测器检测灵敏度最高。磺化Cy5-伯氨可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子等。由于它的良好水溶性，它比普通Cy5-伯氨更适合标记蛋白。
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接，从而把Cy5分子连接到目标分子上。
磺化Cy5-伯氨的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy5水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy5-伯氨也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行。
磺化Cy5-伯氨标记后的产物Ex/Em是649/672nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。
ex/em : 649/672 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 271000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.28
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接，从而把Cy5分子连接到目标分子上。
磺化Cy5-伯氨的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy5水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy5-伯氨也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行。
磺化Cy5-伯氨标记后的产物Ex/Em是649/672nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。
- 磺化Cy5水溶性高，极性强，如需脂溶性标记染料，请选择普通Cy5-伯氨。
- 标记时使用不含氨基的缓冲体系，比如磷酸钠缓冲液（PBS），Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液；或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等，它们会和磺化Cy5上的伯胺竞争。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
化学性质
外观 : 深蓝色固体ex/em : 649/672 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 271000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.28