5-碘-2'-脱氧胞苷

5-碘-2'-脱氧胞苷

中文名称5-碘-2'-脱氧胞苷
中文同义词2'-脱氧-5-碘胞苷;碘脱氧胞苷;伊巴他滨;5-碘-2'-脱氧胞嘧啶核苷;5-碘-2'-脱氧胞苷;5-碘-脱氧胞苷;5-碘-2'-脱氧胞苷(5-I-DC);4-氨基-1-((2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟甲基)四氢呋喃-2-基)-5-碘嘧啶-2(1H)-酮
英文名称5-Iodo-2'-deoxycytidine
英文同义词-deoxyuridine Triphosphate Tetralithium Salt;5-Iodo-deoxycytidine;4-aMino-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxyMethyl)oxolan-2-yl]-5-iodo-1,2-dihydropyriMidin-2-one;4-AMino-1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxyMethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-iodopyriMidin-2(1H)-one;IBACITABINE;5-Iodo-2′-deoxycytidine, >=99%;5-IDC;2'-Deoxy-5-iodo-D-cytidine
CAS号611-53-0
分子式C9H12IN3O4
分子量353.11
EINECS号210-269-8
相关类别修饰核苷;其他生化试剂;原料;核苷;生化试剂;Biochemicals and Reagents;Nucleoside Analogs;植物激素及核酸类;医药原料药;核苷,核苷酸,寡核苷酸;生化试剂-植物激素及核酸类;化学试剂;医用原料;医药原料;通用生化试剂-核酸;Amino Acids;Nucleosides, Nucleotides, Oligonucleotides
Mol文件611-53-0.mol
结构式5-碘-2'-脱氧胞苷 结构式

5-碘-2'-脱氧胞苷 性质

熔点180-183℃
沸点522.1±60.0 °C(Predicted)
密度2.37±0.1 g/cm3(Predicted)
储存条件Keep in dark place,Sealed in dry,Store in freezer, under -20°C
溶解度DMSO:100.0(最大浓度 mg/mL);283.19(最大浓度 mM)
形态粉末
酸度系数(pKa)14.03±0.60(Predicted)
颜色白色
水溶解性Slightly soluble in water.
InChIInChI=1S/C9H12IN3O4/c10-4-2-13(9(16)12-8(4)11)7-1-5(15)6(3-14)17-7/h2,5-7,14-15H,1,3H2,(H2,11,12,16)/t5-,6+,7+/m0/s1
InChIKeyWEVJJMPVVFNAHZ-UHFFFAOYSA-N
SMILESOC[C@H]1O[C@@H](N2C=C(I)C(N)=NC2=O)C[C@@H]1O
CAS 数据库611-53-0(CAS DataBase Reference)

5-碘-2'-脱氧胞苷 用途与合成方法

Ibacitabine 是一种抗病毒化合物,可用于基因测序。
生产方法 
2’-脱氧胞苷

951-77-9

5-碘-2'-脱氧胞苷

611-53-0

以4-氨基-1-((2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟甲基)四氢呋喃-2-基)嘧啶-2(1H)-酮(dC)为原料合成4-氨基-1-((2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟甲基)四氢呋喃-2-基)-5-碘嘧啶-2(1H)-酮的一般步骤:在火焰干燥的圆底烧瓶中,将10.0 g dC(44.0 mmol,1.0当量)、7.70 g碘(26.4 mmol,0.6当量)和11.4 g mCPBA(70%,46.2 mmol,1.05当量)溶解于120 mL DMF中。反应混合物在室温下搅拌2小时,随后蒸发至干(在随后的柱色谱法中可接受少量DMF残留)。通过柱色谱法纯化(洗脱剂比例:DCM/MeOH/H2O/NH3 190:10:0.6:0.6 → 90:10:0.6:0.6),得到9.71 g(产率63%)目标化合物1,为橙色固体。产物表征数据如下:1H NMR (400 MHz, CDCl3/MeOD) δ (ppm) = 8.46 (s, 1H), 6.13 (t, 3J = 6.0 Hz, 1H), 4.34 (dt, 3J = 4.7, 6.3 Hz, 1H), 3.93 (dt, 3J = 3.0, 4.3 Hz, 1H), 3.84 (dd, 3J = 3.0, 2J = 12.1 Hz, 1H), 3.72 (dd, 3J = 3.2, 2J = 12.1 Hz, 1H), 2.39 (ddd, 3J = 4.8, 6.3, 2J = 13.7 Hz, 1H), 2.20-2.09 (m, 1H)。13C NMR (101 MHz, MeOD) δ (ppm) = 163.9, 153.9, 150.9, 89.5, 88.3, 71.5, 62.2, 56.2, 42.5。HRMS (ESI+) 计算值 C9H13IN3O4+ [M+H]+: 353.9945,实测值: 353.9944。熔点范围: 133-135°C(分解)。IR (ATR): 3191 (w), 1718 (m), 1642 (s), 1286 (m), 1087 (s), 957 (s), 750 (m)。

参考文献:

[1] Organic Letters, 2010, vol. 12, # 24, p. 5671 - 5673

[2] Patent: WO2012/62907, 2012, A1. Location in patent: Page/Page column 13; 14

[3] Patent: US2013/237697, 2013, A1. Location in patent: Paragraph 0052-0055

[4] Synthesis, 2009, # 23, p. 3957 - 3962

[5] Patent: US2012/178919, 2012, A1. Location in patent: Page/Page column 4

安全信息

危险品标志Xn,T
危险类别码22-63-42/43-36/37/38
安全说明23-26-36/37/39-24/25
WGK Germany3
海关编码29071212

MSDS信息

更新日期产品编号产品名称CAS号包装价格
2026/06/06I08825-碘-2'-脱氧胞苷
5-Iodo-2'-deoxycytidine
611-53-01g60元
2026/06/05HY-W0111385-碘-2'-脱氧胞苷
Ibacitabine
611-53-05 g229元

5-碘-2'-脱氧胞苷 上下游产品信息

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