Cy5.5-炔烃
| 中文名称 | Cy5.5-炔烃 |
|---|---|
| 中文同义词 | CY5.5-炔基;荧光CYANINE5.5菁染料标记炔烃;花青5.5炔(氯化物);CY5.5-ALKYNE脂溶;菁染料CY5.5炔基;花菁染料 CY5.5 ALKYNE;1,1-二甲基-3-(6-氧代-6-(丙-2-炔-1-基氨基)己基)-2-(5-(1,1,3-三甲基-1,3-二氢-2H-苯并[E]吲哚-2-基)戊-1,3-二烯-1-基)-1H-苯并[E]吲哚-3-鎓氯化物;酯溶CY5.5(甲基)炔丙酰胺 |
| 英文名称 | Cy5.5 alkyne |
| 英文同义词 | Cy5.5 alkyne;CY5.5 ALK;Cyanine5.5 alkyne (chloride);1,1-Dimethyl-3-(6-oxo-6-(prop-2-yn-1-ylamino)hexyl)-2-(5-(1,1,3-trimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-1H-benzo[e]indol-3-ium chloride;lipo Cy5.5(Me) YNE;S-(2-(((((2R,3S,5R)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl)oxy)(pyrrolidin-1-yl)phosphanyl)thio)ethyl) benzothioate |
| CAS号 | 1628790-37-3 |
| 分子式 | C43H46ClN3O |
| 分子量 | 656.31 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 化学试剂;荧光染料 |
| Mol文件 | 1628790-37-3.mol |
| 结构式 |  |
Cy5.5-炔烃 性质
| 溶解度 | 溶于DMSO、DMF、DCM |
|---|---|
| 形态 | Solid |
| 颜色 | Pink to red |
| 外观 | Dark blue solid |
| ε(消光系数) | 198000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.20 |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 680/698 nm (PBS buffer) |
| InChIKey | ZAMUEMBIJDLVQF-UHFFFAOYSA-N |
| SMILES | CC1(C(=[N+](CCCCCC(=O)NCC#C)C2C=CC3=CC=CC=C3C1=2)C=CC=CC=C1N(C2C=CC3=CC=CC=C3C=2C1(C)C)C)C.[Cl-] |
Cy5.5-炔烃 是一种炔基修饰的近红外 (NIR) 荧光染料 (Ex=678 nm, Em=694 nm)。 Cyanine5.5 alkyne chloride 可与叠氮化物反应，用于点击化学标记。Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一种发近红外（NIR）荧光的花青素荧光染料。它的消光系数高，荧光也很亮，并且对pH不敏感，并且由于它的荧光波长（Em：~700nm）恰好处于肌体组织近红外窗口 I 的区域（肌体的血液，体液和组织此区域背景荧光弱，而长波长穿透性强），所以Cy5.5常应用于小动物活体体内成像中。 Cy5.5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，纳米粒等，它最常见的使用是标记核酸分子（DNA和RNA）。
炔烃(alkyne)是常用生物标记基团。通过铜催化点击化学反应(Copper-catalyzed azide–alkyne cycloaddition, CuAAC)，炔烃可以和叠氮(azide)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速完成，即便在低浓度(μM)下。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。
Cy5.5标记后的产物Ex/Em是680/698nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 680，DyLight 680等。
ex/em : 680/698 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 198000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.20
炔烃(alkyne)是常用生物标记基团。通过铜催化点击化学反应(Copper-catalyzed azide–alkyne cycloaddition, CuAAC)，炔烃可以和叠氮(azide)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速完成，即便在低浓度(μM)下。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。
Cy5.5标记后的产物Ex/Em是680/698nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 680，DyLight 680等。
- Cy5.5-炔烃水溶性较低，如需在水相中标记可选择磺化Cy5.5-炔烃。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
化学性质
外观 : 深蓝色固体ex/em : 680/698 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 198000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.20