2'- 脱氧肌苷是由次黄嘌呤与2'-脱氧核糖通过 β-N9-糖苷键连接形成的脱氧核苷,天然存在于DNA中,也是重要的分子生物学工具与药物合成中间体。
有机应用
5’-S-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧肌苷的制备:常温下,向反应瓶中持续通入氨气,向反应瓶中依次加入2'-脱氧肌苷、4,4'-二甲氧基三苯甲基硫醇、配位膦化合物、质子酸(对照例不加)和有机溶剂,滴入偶氨试剂,继续反应约3-4小时,用薄层色谱TLC检测反应液,直至无2'-脱氧肌苷(展开剂条件:二氯甲烷:甲醇=5:1,Rf=0.3)指示反应结束;将反应液转移至分液漏斗中,向反应液中加入乙酸乙酯400mL,再加入饱和碳酸氢钠溶液1LX3(洗涤3次)萃取分层,取上层有机相,经无水硫酸钠干燥,对去除无水硫酸钠后的有机相旋除有机溶剂,将得到的粘稠状粗品上硅胶柱层析(层析条件,乙酸乙酯:二氯甲烷:甲醇=10 :10:1),得到白色固体[1]。

将购买的2'-脱氧肌苷(500毫克,1.98毫摩尔)悬浮于N,N-二甲基甲酰胺(13毫升)中。向该混合液中加入咪唑(944.7毫克,13.9毫摩尔)与叔丁基二甲基氯硅烷(1.20克,7.93毫摩尔),室温下搅拌反应过夜。向反应液中加水,继续搅拌30分钟。反应液经乙酸乙酯萃取,再用无水硫酸镁干燥。减压蒸除溶剂,残余物溶于甲基叔丁基醚,随后向溶液中加入正己烷;过滤析出的固体,得到9-((2R,4S,5R)-4-(叔丁基二甲基硅氧基)-5-((叔丁基二甲基硅氧基)甲基)四氢呋喃-2-基)-1H-嘌呤-6(9H)-酮(886毫克,收率93%)[2]。

6-(3-甲氧基苄胺基)-9-β-D-2'-脱氧呋喃核糖基嘌呤的合成:将2'-脱氧肌苷(252毫克)与苯并三氮唑 -1-基氧基三(二甲基氨基)磷鎓六氟磷酸盐(BOP,531毫克)溶于无水N,N-二甲基甲酰胺(5毫升)中,氩气保护下室温搅拌。5分钟后,加入N,N-二异丙基乙胺(DIPEA,261ul)和3-甲氧基苄胺(167ul),室温搅拌反应16小时。采用薄层色谱(TLC)监测反应进程,展开剂配比为三氯甲烷-甲醇-25%氨水=4:1:0.05。检测发现原料未完全转化,补加BOP(354毫克,0.8毫摩尔),将反应体系升温至60℃,继续搅拌6小时。待薄层色谱中2'- 脱氧肌苷原料点完全消失后,使用真空旋转蒸发仪(最高温度55℃)浓缩反应液,得到约1.5克粗产物。粗产物经硅胶柱色谱(硅胶用量150克)分离纯化,洗脱剂为二氯甲烷体系,甲醇浓度梯度0~20%。最终产物收量270毫克,收率79%;高效液相色谱-质谱联用(HPLC-MS)检测纯度≥98%[3]。

参考文献
[1] 中国医药研究开发中心有限公司. 5’-S-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧肌苷的合成与制备方法:CN201310053524.2[P]. 2013-05-01.
[2] Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.. OLIGONUCLEOTIDE HAVING NON-NATURAL NUCLEOTIDE AT 5'-TERMINAL THEREOF:US201515123438A[P]. 2017-12-14.
[3] UNIVERZITA PALACKEHO V OLOMOUCI. 6-ARYL-9-GLYCOSYLPURINES AND USE THEREOF:CZ2015050005W[P]. 2016-06-16.