Cyanine3-叠氮
| 中文名称 | Cyanine3-叠氮 |
|---|---|
| 中文同义词 | CYANINE3-叠氮;花菁素CY3叠氮;Cyanine3叠氮化物 (Cyanine3 azide) |
| 英文名称 | Cyanine3 azide |
| 英文同义词 | Cyanine3 azide;3H-Indolium, 2-[3-[1-[6-[(3-azidopropyl)amino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-2H-indol-2-ylidene]-1-propen-1-yl]-1,3,3-trimethyl-, chloride (1:1) |
| CAS号 | 1167421-28-4 |
| 分子式 | C33H43N6O.Cl |
| 分子量 | 575.19 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 基准试剂;化学试剂 |
| Mol文件 | 1167421-28-4.mol |
| 结构式 |  |
Cyanine3-叠氮 性质
| 溶解度 | 溶于DMF、DMSO、DCM |
|---|---|
| 形态 | 固体 |
| 颜色 | 绿色至深绿色 |
| 外观 | Red powder |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 554/566 nm (PBS buffer) |
| ε(消光系数) | 150000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.31 |
Cyanine3-叠氮 是Cy3 azide 的类似物，是一种高效的绿色荧光染料。Cyanine3 azide chloride 使用 click 化学与炔标记的蛋白质结合。Cyanine3 azide chloride 可以用荧光计、成像仪和显微镜检测。(λex=684 nm，λem=710 nm)。Cyanine3 azide (chloride) 是一种点击化学试剂。它含有 Azide 基团，可以和含有 Alkyne 基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应（CuAAc)。它还可以和含有 DBCO 或 BCN 基团的分子发生环张力驱动的炔-叠氮环加成反应 (SPAAC)。Cy3 (Cyanine 3) 是一种发橘黄色荧光的花青素荧光染料。它的荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后，Cy3的背景荧光一般认为比TAMRA等TRITC系列的染料低。Cy3可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子，纳米粒等。
叠氮(azide)是常用生物标记基团。通过点击化学反应(click chemistry)，叠氮可以和一系列炔烃(alkyne)或环炔烃(strained alkyne)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速定量完成(几乎100%产率)，即使在低浓度(μM)和低温(4oC)下也可完成。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。
Cy3标记后的产物Ex/Em是554/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
ex/em : 554/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 150000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.31
叠氮(azide)是常用生物标记基团。通过点击化学反应(click chemistry)，叠氮可以和一系列炔烃(alkyne)或环炔烃(strained alkyne)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速定量完成(几乎100%产率)，即使在低浓度(μM)和低温(4oC)下也可完成。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。
Cy3标记后的产物Ex/Em是554/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
- Cy3-叠氮水溶性较低，如需在水相中标记可选择磺化Cy3-叠氮。
- 叠氮化合物可被强还原剂(如DTT)还原破坏，使用时务必去除还原剂。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
化学性质
外观 : 红色粉末ex/em : 554/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 150000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.31