Cy5.5-SE
| 中文名称 | Cy5.5-SE |
|---|---|
| 中文同义词 | 2-(5-(3-(6-((2,5-二氧代吡咯烷-1-基)氧基)-6-氧代己基)-1,1-二甲基-6,8-二磺基-1,3-二氢-2H-苯并[E]吲哚-2-基)戊-1,3-二烯-1-基)-3-乙基-1,1-二甲基-8-磺基-1H-苯并[E]吲哚-3-鎓-6-磺酸内盐;荧光标记染料CY5.5;化合物 Cy5.5-SE;磺酸基-Cy5.5-乙基 琥珀酰亚胺酯(远红外);磺化CY5.5活性酯;水溶Cy5.5(乙基)琥珀酰亚胺酯三乙胺盐 |
| 英文名称 | Cy5.5-SE |
| 英文同义词 | Cy5.5-SE;sulfo Cy5.5(Et) NHS;2-((1E,3E,5E)-5-(3-(6-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-1,1-dimethyl-6,8-disulfo-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3-ethyl-1,1-dimethyl-8-sulfo-1H-benzo[e]indol-3-ium-6-sulfonate;Cy5.5 NHS ester (water-soluble);Sulfo-Cy5.5-E SE (FIR);8-OXO-dG(dmf) Phosphoramidite;CID 91810980 |
| CAS号 | 442912-55-2 |
| 分子式 | C45H47N3O16S4 |
| 分子量 | 1014.12 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 荧光染料 |
| Mol文件 | 442912-55-2.mol |
| 结构式 |  |
Cy5.5-SE 性质
| 溶解度 | 易溶于DMSO，DMF等有机溶剂，极易溶于水 |
|---|---|
| 形态 | 固体 |
| 颜色 | 浅蓝至蓝色 |
| 外观 | Dark blue solid |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 678/706 nm (PBS buffer) |
| ε(消光系数) | 211000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.21 |
| InChIKey | DOMDXTIMIZCSNC-UHFFFAOYSA-N |
| SMILES | CC1(C(N(CCCCCC(=O)ON2C(CCC2=O)=O)C2C=CC3=C(C=C(S(O)(=O)=O)C=C3C1=2)S(O)(=O)=O)=CC=CC=CC1C(C2C3=CC(S(O)(=O)=O)=CC(S([O-])(=O)=O)=C3C=CC=2[N+]=1CC)(C)C)C |
磺化Cy5.5 (sulfo Cyanine 5.5; sulfo Cy5.5) 是一种发近红外(NIR)荧光的花青素类荧光染料。磺化Cy5.5是磺化修饰过的Cy5.5，水溶性好。磺化Cy5.5的消光系数高，荧光也很亮，并且对pH不敏感，并且由于它的荧光波长（Em：706nm）恰好处于肌体组织近红外窗口 I 的区域（肌体的血液，体液和组织此区域背景荧光弱，而长波长穿透性强），所以磺化Cy5.5常应用于小动物活体体内成像中。磺化Cy5.5-NHS可以用来标记蛋白，抗体，多肽,核酸分子等。由于强水溶性加带电荷，磺化花青素标记的生物分子更稳定，不易产生疏水性聚集。
NHS活化酯 （N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物标记反应中最常用的活化基团。它活化Cy5.5分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把Cy5.5分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白，抗体，多肽表面的常见官能团（来自于赖胺酸侧链），磺化Cy5.5-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基，只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和磺化Cy5.5-NHS反应。
磺化Cy5.5-NHS活化酯的水溶性非常好，所以可以在水相的标记反应体系中直接使用，不需要有机溶剂助溶，特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy5.5水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到蛋白表面后不会引发疏水性蛋白聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy5.5-NHS也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行。如需脂溶性Cy5.5染料，可选择普通花青素（cyanine），即Cy5.5-NHS活化酯。
磺化Cy5.5-NHS标记后的产物Ex/Em是678/706nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 680，DyLight 680等。
ex/em : 678/706 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 211000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.21
NHS活化酯 （N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物标记反应中最常用的活化基团。它活化Cy5.5分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把Cy5.5分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白，抗体，多肽表面的常见官能团（来自于赖胺酸侧链），磺化Cy5.5-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基，只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和磺化Cy5.5-NHS反应。
磺化Cy5.5-NHS活化酯的水溶性非常好，所以可以在水相的标记反应体系中直接使用，不需要有机溶剂助溶，特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy5.5水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到蛋白表面后不会引发疏水性蛋白聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy5.5-NHS也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行。如需脂溶性Cy5.5染料，可选择普通花青素（cyanine），即Cy5.5-NHS活化酯。
磺化Cy5.5-NHS标记后的产物Ex/Em是678/706nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 680，DyLight 680等。
- NHS ester基团对湿度比较敏感，务必干燥保存产品。使用前产品需放到室温回温至少20分钟。
- 使用不含氨基的缓冲体系。比如磷酸钠缓冲液（PBS）,Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液；或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢漂白(photobleaching)。
化学性质
外观 : 深蓝色固体ex/em : 678/706 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 211000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.21
安全信息
| 更新日期 | 产品编号 | 产品名称 | CAS号 | 包装 | 价格 |
|---|---|---|---|---|---|
| 2026/06/05 | HY-D0925 | Cy5.5-SE | 442912-55-2 | 1 mg | 2600元 |
| 2024/08/19 | HY-D0925 | Cy5.5-SE Cy5.5-SE | 442912-55-2 | 5 mg | 6500元 |