AF647活性酯
| 中文名称 | AF647活性酯 |
|---|---|
| 中文同义词 | AF647活性酯;AF647 NHS 活化酯;2-[5-[1,3-二氢-3,3-二甲基-5-磺基-1-(3-磺丙基)-2H-吲哚-2-亚基]-1,3-戊二烯基]-3-[6-[(2,5-二氧代-1-吡咯烷基)氧基]-6-氧代己基]-3-甲基-5-磺基-1-(3-磺丙基)-3H-吲哚鎓内盐;OKF 647 琥珀酰亚胺酯;化合物 AF647-NHS ester;3-(2-(5-(3,3-二甲基-5-磺基-1-(3-磺基丙基)吲哚啉-2-亚基)戊-1,3-二烯-1-基)-3-(6-((2,5-二氧代吡咯烷-1-基)氧基)-6-氧代己基)-3-甲基-5-磺基-3H-吲哚-1-鎓-1基)丙烷-1-磺酸内盐 |
| 英文名称 | 3H-Indolium, 2-[5-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-3-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt |
| 英文同义词 | 3H-Indolium, 2-[5-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-3-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt;BP Fluor 647 NHS Ester;AF647 NHS;OKF 647 SE;BP fluor 647 NHS ester trisodium;3-(2-(5-(3,3-Dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)indolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3-(6-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-3-methyl-5-sulfo-3H-indol-1-ium-1-yl)propane-1-sulfonate |
| CAS号 | 407627-60-5 |
| 分子式 | C40H49N3O16S4 |
| 分子量 | 956.08 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 荧光染料 |
| Mol文件 | 407627-60-5.mol |
| 结构式 |  |
AF647活性酯 性质
| 溶解度 | 易溶于水, DMSO, DMF等 |
|---|---|
| 外观 | Dark blue solid |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 651/672 nm |
| ε(消光系数) | 261,000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.33 |
| InChIKey | PIQXJQCAOCUQOD-UHFFFAOYSA-N |
| SMILES | C(C1(C(=[N+](CCCS([O-])(=O)=O)C2=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C12)C=CC=CC=C1C(C2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=C2N1CCCS(O)(=O)=O)(C)C)C)CCCCC(=O)ON1C(CCC1=O)=O |
AF647活性酯 是 Alexa Fluor 647 (AF647) 的类似物。AF647 是一种远红光荧光染料，激发波长 (λex) 为 635 nm (常规荧光检测)/620 nm (瞬时检测)。储存方式：避光。AF647（Alexa Fluor 647）是Alexa Fluor染料家族中一种发远红（far-red）荧光的染料，是最常用的一种AF染料之一，在重要实验中，常常被用于替代Cy5染料。AF647的极性大，水溶性极好，荧光稳定性能也不错，能耐受较长时间照射，特别适应于标记蛋白质，是二抗标记的常规荧光染料。尽管AF647的量子产率不算高，但是其消光系数非常高（即表现为颜色深，分子吸收光子能力强），所以AF647的荧光亮度很高，另外，由于远红光区样品背景弱，而CCD相机对该区光子检测都较灵敏，所以各种因素加成之下，让AF647成为最灵敏的荧光染料之一，常常可检测出丰度非常低的样品。AF647的ex/em和Cy5非常接近，因此在常规荧光显微镜时可使用Cy5滤片组；在共聚焦显微成像时，633nm激光束可以良好的激发该染料，594nm激光也可以通过该染料的肩峰激发，很好的适配了生物实验室常规平台激光器，包括常规共聚焦显微镜、流式细胞仪和荧光扫描仪等。
NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester, SE)是生物标记反应中最常用的活化基团。NHS活化AF647分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（主要伯胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把AF647荧光分子标记到生物大分子上。
ex/em : 651/672 nm
消光系数(ε) : 261,000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.33
NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester, SE)是生物标记反应中最常用的活化基团。NHS活化AF647分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（主要伯胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把AF647荧光分子标记到生物大分子上。
化学性质
外观 : 深蓝色固体ex/em : 651/672 nm
消光系数(ε) : 261,000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.33