香料和香精：苯乙酸甲酯具有强烈的甜润、细腻的蜜香香气，并伴有藿香香韵，因此广泛用于香料和香精的调配中。它可用于调制花香型香精，如玫瑰、野蔷薇等香精，以及用于化妆品、日用品、肥皂和室内空气清新剂等。
食品添加剂：由于其独特的香气，苯乙酸甲酯也用于食品添加剂中，特别是用于调制蜂蜜、巧克力等香型香精，提升食品的香味。
医药中间体：在医药领域，苯乙酸甲酯作为有机合成试剂，可用于构建多种具有抗炎性生物活性分子和药物分子。例如，它是阿托品的关键合成中间体，阿托品主要用于解除平滑肌痉挛，改善微循环，抑制腺体分泌，解除迷走神经对心脏的抑制，使心搏加快、瞳孔散大、眼压升高，兴奋呼吸中枢，解除呼吸抑制。
有机合成：苯乙酸甲酯在有机合成中也有广泛应用，可以作为前体物质，通过进一步的化学反应生成其他复杂的有机分子。
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