DMT-dG(ib)亚磷酰胺单体全称：5'-O-(4,4-二甲氧基三苯甲基)-N²-异丁酰基-2'-脱氧鸟苷-3'-(2-氰基乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺，白色至类白色固体粉末，易吸潮，溶于无水乙腈、二氯甲烷、DMSO；遇水快速分解。DMT-dG(ib)亚磷酰胺单体可合成普通DNA引物、基因片段、反义寡核苷酸ASO、siDNA、CRISPR向导DNA、测序探针等，是实验室最通用脱氧鸟苷亚磷酰胺单体。
合成方法
活化剂碱(1.1-1.2当量)加入到溶剂中，随后在室温下加入0.95-1.1当量的活化剂酸形成活化剂溶液。在单独的容器中约1当量的保护性核苷iBu-DMT-dG溶解于约10当量的溶剂中，然后减压蒸馏出约3当量的溶剂THF。约1-1.2当量的2-氰基乙基-N,N,N,N’-四异丙基亚磷二酰胺室温下加入到核苷混合物中，然后室温下随着剧烈的搅拌将先前制备的活化剂溶液加入到核苷混合物中。12小时后，反应混合物用甲苯稀释并用水洗涤。分出有机层，如果需要经硫酸钠干燥，减压浓缩。然后利用HPLC技术计算所要的酰胺(amidite)的收率，也就是，所得的产物混合物利用适合的洗脱剂通过HPLC柱，使用HPLC峰下的面积确定混合物中产物DMT-dG(ib)亚磷酰胺单体%收率[1]。
衍生物
将化合物12‑1 DMT-dG(ib)亚磷酰胺单体(100g,119.06mmol,1eq),N,N‑二甲基甲酰胺二甲基缩醛(42.56g,357.17mmol,3eq)加入到盛有甲醇(1.0L)的瓶中,该反应在35℃搅拌12小时。LCMS检测反应完全,反应液减压浓缩。加入乙酸乙酯(1000mL)，用半饱和食盐水(1000mL)洗涤2次，有机相用无水硫酸钠干燥，过滤，滤液减压浓缩。粗品经柱分离(石油醚:乙酸乙酯＝1:0到0:1 ,加0.3％的三乙胺)洗脱,得到类白色固体化合物WX012(57g,收率:58％,纯度:99.1％)[2]。
在氩气气氛下，向30mL的双口烧瓶中加入HO‑T(S)T‑SUC‑TOB(250mg，88μmol)、无水二氯甲烷(4.4mL)和无水乙腈(1.3mL)，调制了溶液。之后，依次加入DMT-dG(ib)亚磷酰胺单体(149mg，176μmol)和5‑乙基硫基‑1H‑四唑(23mg，0.18mmol)，将溶液在室温下搅拌45分钟。之后，向溶液中加入2,2,2‑三氟乙醇(38μL，0.53mmol)，将溶液在室温下搅拌30分钟。接下来，加入水(70μL)和2,2’‑二苯并噻唑基二硫化物(59mg，18mmol)，将溶液在室温下搅拌60分钟。对溶液的一部分进行取样后，向溶液中依次加入2,3‑二甲基呋喃(46μL，0.88mmol)和三氟乙酸(102μL，1.32mmol)，将溶液在室温下搅拌80分钟。接下来，向溶液中依次加入吡啶(319μL，3.95mmol)和水(19μL)，将溶液在室温下搅拌90分钟。之后，添加乙腈，将析出的固体通过使用了KIRIYAMA漏斗的抽吸过滤回收后，进行干燥，得到了作为三聚体的寡核苷酸HO‑G(O)T(O)T‑SUC‑TOB(111mg)[3]。
参考文献
[1] 霍尼韦尔国际公司. 制备亚磷酸酯化(phosphitylated)化合物的方法:CN03808763.4[P]. 2008-04-09.
[2] 天津药明康德新药开发有限公司,常州合全药业有限公司. 一种亚磷酰胺单体的合成方法:CN202411954718.4[P]. 2025-07-01.
[3] 味之素株式会社. 寡核苷酸的制备方法:CN202280014458.5[P]. 2023-10-13.