N-苄氧羰酰基-2-甲基丙氨酸在气相下窥探3??螺旋的应用

2026/7/5 8:01:31 作者:电离式

介绍

N-苄氧羰酰基-2-甲基丙氨酸的结构由三部分构成:N 端的苄氧羰基(Z 基)作为封端基团,同时提供了紫外生色团,满足单构象光谱检测的光学需求;中间为单个 Aib 残基,是构象调控的核心单元;C 端为游离羧基(-OH)。作为仅含一个Aib残基的单体分子,它的骨架长度不足以形成 3₁₀螺旋标志性的 i+3转到i型 10 元环(C10)氢键,因此它可以完全排除长程氢键作用的干扰,直接反映 Aib 残基本身的构象倾向。

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图一 N-苄氧羰酰基-2-甲基丙氨酸

气相单构象光谱

为获取孤立分子的本征构象信息,采用了超声射流冷却结合激光解吸的气相制备方案:将N-苄氧羰酰基-2-甲基丙氨酸样品通过 1064 nm 激光解吸进入气相,由高压氩气载带并在超声膨胀中碰撞冷却,使分子布居到能量最低的构象的振动基态,从而消除常温下的构象互变与谱线展宽。构象分析则依托多组激光光谱技术联用实现:通过共振双光子电离(R2PI)扫描获取分子的紫外电子激发光谱,初步识别不同构象的信号;利用红外 - 紫外烧孔(IR-UV HB)光谱,将重叠的 R2PI 谱拆分为单个构象的专属紫外谱;最终通过共振离子凹陷红外光谱(RIDIRS),采集每个构象在 NH/OH 伸缩区的高分辨红外光谱,结合 M05-2X/6-31+G (d) 水平的密度泛函理论计算,完成结构的精准归属。

双构象共存与螺旋雏形

气相冷却后的N-苄氧羰酰基-2-甲基丙氨酸存在两种稳定构象,二者呈现出截然不同的结构特征。

优势构象 A:伸展型 C5 氢键结构

构象 A 是N-苄氧羰酰基-2-甲基丙氨酸的全局能量最低构象,在 R2PI 谱中对应 37602 cm⁻¹ 的电子起源峰,也是样品中的主导组分。其结构特征为:Aib 残基的骨架二面角 φ,ψ=-180°, -180°,接近完全伸展的平面构象;分子内存在一个 C5 型氢键,即氨基氢与跨残基的羰基氧形成五元环氢键作用;C 端羧基保持顺式构型。该构象的总偶极矩仅为 1.5 D,结构与同等长度的 Z-Gly-OH 优势构象高度相似,体现了短肽单体在无侧链强约束时的共性伸展偏好。

次要构象 B:无氢键的螺旋型骨架

N-苄氧羰酰基-2-甲基丙氨酸的构象B为含量较低的次要构象,电子起源峰位于 37576 cm⁻¹。该构象不存在任何分子内氢键作用,但其 Aib 残基的骨架二面角为 φ,ψ=-49°, 37°,与理想 3₁₀螺旋的特征二面角(φ,ψ=-57°, -30°)高度吻合。仅单个 Aib 残基就已经具备向螺旋构象偏转的内在倾向,这种偏好不依赖10元环氢键的稳定作用,而是完全源于 α- 碳双甲基带来的空间位阻效应,两个甲基的立体排斥将骨架二面角严格限制在拉氏图的螺旋区域内。同时,该构象的偶极矩升至 3.3 D,是构象 A 的两倍以上,也初步体现了螺旋结构的偶极积累特征[1]。

两种构象.png

图二 两种构象

参考文献

[1]R J G ,M D H ,O A H , et al.Conformation-specific spectroscopy of capped, gas-phase Aib oligomers: tests of the Aib residue as a 310-helix former.[J].Physical chemistry chemical physics : PCCP,2016,18(36):25512-25527.

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