花氰染料CY7-氨基
| 中文名称 | 花氰染料CY7-氨基 |
|---|---|
| 中文同义词 | CY7-氨基;近红外染料CY7 NH2;CY7-NH2 花菁染料CY7-氨基;菁染料CY7氨基;荧光染料CY7胺;脂溶CY7氨基;花菁染料CY7氨基;花菁染料 CY7 AMINE |
| 英文名称 | Cyanine7 amine |
| 英文同义词 | Cyanine7 amine;Cyanine7 amine,Cy7 NH2;1-(6-((6-Aminohexyl)amino)-6-oxohexyl)-3,3-dimethyl-2-(2-(3-(2-(1,3,3-trimethylindolin-2-ylidene)ethylidene)cyclohex-1-en-1-yl)vinyl)-3H-indol-1-ium;CY7-NH2 |
| CAS号 | 1650635-41-8 |
| 分子式 | C43H59N4O+ |
| 分子量 | 647.97 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 荧光染料;合成材料中间体 |
| Mol文件 | 1650635-41-8.mol |
| 结构式 |  |
花氰染料CY7-氨基 性质
| 溶解度 | 易溶于甲醇，DMF等有机溶剂，微溶于水 |
|---|---|
| 外观 | Green solid |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 740/770 nm (MeOH/PBS) |
| ε(消光系数) | 199000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.3 |
| InChIKey | XKOKAUKNGUVUFA-UHFFFAOYSA-O |
| SMILES | C([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC=CC=C12)C=CC1CCCC(=CC=C2N(C3=CC=CC=C3C2(C)C)C)C=1)CCCCC(=O)NCCCCCCN |
Cy7 (Cyanine 7) 是一种近红外花青素荧光染料。由于它的荧光波长（Em：773nm）恰好处于肌体组织近红外窗口 I 的区域（肌体的血液，体液和组织此区域背景荧光弱，而长波长穿透性强），所以Cy7常常应用于小动物活体体内成像中。Cy7荧光肉眼不可见，并且显微镜观察时需要近红外滤片，很多荧光显微镜（包括共聚焦显微镜）并不配备，但是流式细胞仪（flow cytometry）常常配备Cy7滤片组。Cy7是常用荧光染料，Cy7可以用来标记核酸，蛋白，抗体，多肽，纳米粒等，它是最常见的小动物显影剂之一。
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接，从而把Cy7分子连接到目标分子上。
Cy7-伯胺的水溶性较低，所以在水相的标记反应体系内需要使用有机共溶剂，常用有机溶剂包括DMF，DMSO和乙腈等。如需标记的分子对有机溶剂敏感，可选择磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化-Cy7-伯胺。两者的光谱性质几乎一致，因此大部分应用可相互替换。两者的主要区别在于：磺化染料是水溶性的，在水相的标记反应体系内不需要使用有机共溶剂，并且降低染料在水中聚集的可能性，增强标记效率。
Cy7-伯胺标记后的产物Ex/Em是750/773nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 750，DyLight 755等。
ex/em : 740/770 nm（MeOH/PBS）
消光系数(ε) : 199000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.3
伯胺基(primary amine)是生物标记反应中常用的基团。蛋白表面赖氨酸侧链(residue)官能团就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),异氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基团反应生成稳定链接，从而把Cy7分子连接到目标分子上。
Cy7-伯胺的水溶性较低，所以在水相的标记反应体系内需要使用有机共溶剂，常用有机溶剂包括DMF，DMSO和乙腈等。如需标记的分子对有机溶剂敏感，可选择磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化-Cy7-伯胺。两者的光谱性质几乎一致，因此大部分应用可相互替换。两者的主要区别在于：磺化染料是水溶性的，在水相的标记反应体系内不需要使用有机共溶剂，并且降低染料在水中聚集的可能性，增强标记效率。
Cy7-伯胺标记后的产物Ex/Em是750/773nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 750，DyLight 755等。
- Cy7-伯胺水溶性较低，标记反应可在有机溶剂中进行或者含有机助溶剂的水相中进行。
- 标记时使用不含氨基的缓冲体系，比如磷酸钠缓冲液（PBS），Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液；或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等，它们会和Cy7上的伯胺竞争。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。
花氰染料CY7-氨基常应用于生物分子标记，荧光成像以及其他荧光生物分析。
化学性质
外观 : 绿色固体ex/em : 740/770 nm（MeOH/PBS）
消光系数(ε) : 199000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.3