介绍
4-甲基吲哚常呈淡黄色液体，理论氢存储密度达5.76wt%，易溶于乙醇、二氯甲烷等有机溶剂，微溶于水；它是优质液体有机氢载体（LOHC），在5wt%Ru/Al₂O₃催化下160-200℃、7MPa可完全氢化为八氢4-甲基吲哚，5wt%Pd/Al₂O₃催化下150℃70min可完全脱氢，循环3次后氢化能力仍超90%、脱氢能力近100%，适用于氢的安全存储与运输。
4-甲基吲哚
应用
作为非极性碱基探针
4-甲基吲哚的β-脱氧核苷（M）可以被设计为2'-脱氧腺苷（A）的非极性等排体，将其嵌入30碱基对的DNA双链中，构建中心碱基对为OG:M、G:M的底物duplex，WTMutY对OG:Mduplex的亲和力极高（Kd=0.17±0.05nM），与结构接近A的FA类似物（Kd=0.12±0.05nM）相当，且比OG:Zduplex（Kd=3.4±1.7nM）高20倍。4-甲基吲哚（M）无法与OG形成氢键，但其非极性结构反而消除了碱基对解离的能量消耗，更易促进核苷酸翻转，即损伤碱基从DNA双螺旋中挤出，进入酶的催化口袋，从而补偿了氢键作用的缺失，提升结合亲和力。
此外，截短型Stop225对OG:Mduplex的亲和力（Kd=1.4±0.3nM）虽比WT低8倍，但仍显著高于其对OG:FAduplex的亲和力（Kd=90±10nM），且保留对OG:M优于G:M的识别偏好。这表明C端结构域对依赖氢键的底物（如FA）识别至关重要，但对非极性的M而言，其本身易从DNA双链中挤出的特性，降低了对C端结构域的依赖，4-甲基吲哚通过促进核苷酸翻转能够辅助MutY识别。
辅助机制
含OG:M的11碱基对duplex（Tm=43.4±0.4℃）比OG:A（Tm=55.9±0.5℃）、OG:Z（Tm=49.6±0.8℃）更不稳定。这种不稳定性促进了MutY诱导的DNA构象变化（如双螺旋局部解旋），使得M更易被翻转至酶的催化口袋，成为MutY高效识别的结构基础。4-甲基吲哚的非极性特征规避了传统A类似物与酶的特异性氢键作用干扰，直接靶向核苷酸翻转，有利于BER（碱基切除修复）酶的损伤识别[1]。
参考文献
[1]L C C ,R C L ,H N C , et al.Recognition of the nonpolar base 4-methylindole in DNA by the DNA repair adenine glycosylase MutY.[J].Organic letters,2000,2(9):1341-4.